系統(tǒng)性硬皮病的云數據庫創(chuàng)建、臨床數據分析、全血miRNA篩查與靶基因預測.pdf

1、背景和目的:系統(tǒng)性硬皮病(系統(tǒng)性硬化癥，SSc)是一類以皮膚、內臟器官（肺、心臟、消化道、腎臟等）進行性纖維化為主要表現(xiàn)的自身免疫性結締組織病(AI-CTD)，可由于廣泛的器官受累引起皮膚硬化、肢體殘障及臟器功能衰竭。目前對該病的發(fā)病機制的研究尚處于探索階段，缺乏行之有效的治療手段。本研究旨在研發(fā)適用于SSc臨床研究的云數據庫（網絡數據庫），科學化采集并分析疾病臨床數據，同時評估SSc患者健康相關生活質量，并進行全血miRNA深度測序、

2、靶基因預測及GO分析等，以便全面認識病情并尋找可能的治療靶點。
　　方法:
　　1、根據臨床需求建立以SSc為范例的新型網絡數據庫——云數據庫，首先通過紙質表格搜集患者個人情況、圖片資料、標本信息、血生化指標、皮膚系統(tǒng)受累情況及自評量表計分等，隨后進行云數據庫的數據錄入、分析、計算;在此過程中改進云數據庫結構框架及邏輯關系，總結云數據庫在皮膚科患者信息管理中的應用經驗。
　　2、以云數據庫資料為基礎進行SSc流行病學的

3、描述性研究:搜集205例SSc患者的個人信息及臨床資料，對性別、發(fā)病年齡、病程、臨床表現(xiàn)、重要輔助檢查結果等進行描述及分析。搜集90例SSc患者及50例健康對照的基本資料，分組進行HAQ-DI量表、VAS量表及SAQ量表的自評打分，87例SSc患者及50例健康對照進行SF-36量表的自評打分;使用秩和檢驗等統(tǒng)計學方法對量表結果進行比較和分析。
　　3、使用深度測序法檢測8例中國漢族女性SSc患者和5例健康女性患者全血miRNA，確

4、定組間具顯著表達差異的miRNAs，使用cytoscape等分析軟件及DAVID Bioinformatics Resources6.7等生物信息學網站進行靶基因預測及GO分析。
　　結果:
　　1、成功創(chuàng)建了針對SSc臨床研究的云數據庫，實現(xiàn)了多點操作和異地存儲等復雜應用。搜集、收錄并處理了205例患者個人資料及臨床信息。
　　2、臨床研究結果(1)描述性研究結果:205例患者中性別比例男∶女約為1∶9.1，發(fā)病年齡

5、大于50歲者占42.65％，首發(fā)癥狀最多見為雷諾現(xiàn)象(77.06％)和皮膚硬化(49.49％);合并心臟呼吸系統(tǒng)、腎臟系統(tǒng)、消化系統(tǒng)同時受累的男性占男性患者的25.0％，高于合并多系統(tǒng)受累的女性患者比例(15.0％)，ANA及scl-70等免疫指標在不同臨床亞型中陽性率不同，d-SSc患者（彌漫型）陽性率最高，分別為68.09％和51.06％。CREST綜合征的患者100％出現(xiàn)了肺間質纖維化的影像學改變。
　　(2)健康相關生活質

6、量研究結果:1.HAQ-DI量表結果顯示在穿衣整飾、個人清潔及獲取、握指等項目病例組較之對照組得分更高，即患者的精細機體功能較健康人群明顯受損。VAS量表各項得分病例組均明顯高于對照組，表明疼痛感及雷諾現(xiàn)象等癥狀嚴重影響患者生活質量。SAQ量表的四系統(tǒng)獨立得分（血管系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)、消化系統(tǒng)、肌肉骨骼系統(tǒng)）存在明顯組間差異，病例組均高于對照組，表明患者存在多系統(tǒng)功能減退。2.SF-36量表結果顯示患者在生理機能、生理職能、軀體疼痛、一般健

7、康狀況、精力、社會功能、情感職能、精神健康狀況等各項得分均低于對照組，其中d-SSc組得分最低，HRQOL受損最嚴重;健康變化得分不具有組間差異。
　　3、病例組（B組）的miRNA的表達與對照組（C組）存在差異:BⅠ組vsC組出現(xiàn)表達差異的miRNA共94個，其中上調37個，下調57個;BⅡ組vsC組出現(xiàn)表達差異的miRNA共82個，其中上調26個，下調56個。兩組具顯著表達差異的miRNA對應的靶基因重疊部分經過GO分析及功能

8、富集共得到相互作用通路的21個靶基因及功能作用蛋白，其中包含5個靶基因:ACVR2B、BMP7、BMPR2、HGP與TNF，這5個靶基因分別指向6個miRNA:miR24-2-5p，miR1976，miR671-5p,miR939-5p,miR1229及miR491-5p。
　　結論：
　　1、云數據庫可以高效的儲存并處理以SSc為代表的自身免疫性皮膚病患者的資料、數據、圖片等，數據導出與計算快捷靈活、使用方便，其實際應用對

9、信息管理、臨床科研及醫(yī)療決策具有重要意義。
　　2、臨床研究結論
　　(1)描述性研究結論:SSc女性發(fā)病率明顯高于男性，但男性患者病情更為嚴重，多系統(tǒng)受累更常見。50歲以上人群的發(fā)病率較高，常見的首發(fā)癥狀為雷諾現(xiàn)象和皮膚硬化。彌漫型SSc患者的ANA和scl-70陽性率較其他亞型更高。CREST綜合征患者肺部影像學結果陽性率最高。
　　(2)健康相關生活質量研究結論:SSc患者較之健康人群的健康生活質量存在明顯下降，