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文檔簡(jiǎn)介
1、研究目的:
我國(guó)是胃癌多發(fā)的國(guó)家,居世界之首。研究表明,長(zhǎng)鏈非編碼 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)與胃癌發(fā)生發(fā)展有密切聯(lián)系。lncRNA的作用機(jī)制多種多樣,它可以通過(guò)RNA產(chǎn)物和轉(zhuǎn)錄后干擾等調(diào)控基因的表達(dá)。雖然,人們對(duì)lncRNA的作用機(jī)制有一定的認(rèn)識(shí),但是lncRNA研究還處于起步階段,還有很多問(wèn)題尚未解決。本課題組前期研究發(fā)現(xiàn) fer-1樣家族成員4(fer-1-like family mem
2、ber4,F(xiàn)ER1L4)這一lncRNA在胃癌組織中低表達(dá),但其具體作用機(jī)制尚不完全清楚。為此,本論文以FER1L4作為研究的對(duì)象,采用多種技術(shù)手段,探究FER1L4抑制胃癌發(fā)生的機(jī)制。
實(shí)驗(yàn)方法:
1.采用功能缺失策略,設(shè)計(jì)FER1L4的shDNA模板序列,將其插入慢病毒干擾載體pGLV3/H1/GFP+Puro中,構(gòu)建慢病毒干擾載體,使其能轉(zhuǎn)錄出FER1L4的shRNA。
2.采用功能獲得策略,合成FE
3、R1L4功能片段,并將其插入慢病毒表達(dá)載體pLVX-Puro中,構(gòu)建慢病毒過(guò)表達(dá)載體。
3.慢病毒干擾載體和慢病毒過(guò)表達(dá)載體分別與包裝載體一起共轉(zhuǎn)染人腎HEK293T工具細(xì)胞,進(jìn)行慢病毒包裝,以獲得病毒液。
4.病毒液感染正常胃黏膜上皮細(xì)胞GES-1和不同分化程度的胃癌細(xì)胞AGS、MGC-803和SGC-7901。Puromycin篩選穩(wěn)定下調(diào)和上調(diào)FER1L4的細(xì)胞株。
5.收集穩(wěn)定下調(diào)和上調(diào)FER1L4
4、細(xì)胞株,提取總RNA,對(duì)總RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄和FER1L4的實(shí)時(shí)熒光定量分析,檢測(cè)FER1L4水平是否下調(diào)和上調(diào)。
6. RTCA檢測(cè)穩(wěn)定下調(diào)和上調(diào)FER1L4后,細(xì)胞的增殖情況。克隆形成實(shí)驗(yàn)檢測(cè)穩(wěn)定下調(diào)和上調(diào)FER1L4后,細(xì)胞的克隆形成情況。
7.為進(jìn)一步驗(yàn)證FER1L4的抑癌作用,設(shè)計(jì)并合成FER1L4基因CRISPR Cas-9的sgRNA,并將其插入到CRISPR Cas-9載體pX330和pX335中。細(xì)胞
5、轉(zhuǎn)染,提取總RNA,檢測(cè)CRISPR Cas-9敲除FER1L4后,細(xì)胞中FER1L4 RNA的水平檢測(cè)。RTCA檢測(cè)CRISPR Cas-9敲除FER1L4后,細(xì)胞的增殖情況。
8.檢測(cè)下調(diào)和上調(diào)FER1L4后,細(xì)胞中PTEN的水平。檢測(cè)miR-106a-5p抑制劑處理正常胃黏膜上皮細(xì)胞株和胃癌細(xì)胞株后,F(xiàn)ER1L4和PTEN的水平,以證明FER1L4和PTEN mRNA的競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA關(guān)系。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
6、 1.成功建立FER1L4慢病毒穩(wěn)定干擾細(xì)胞和慢病毒穩(wěn)定過(guò)表達(dá)細(xì)胞株,qRT-PCR檢測(cè)到細(xì)胞中FER1L4的水平的下降和上升符合預(yù)期。
2.細(xì)胞中FER1L4水平下調(diào)后,細(xì)胞增殖加快,克隆增多;而細(xì)胞中FER1L4水平上調(diào)后,細(xì)胞增殖減慢,克隆減少。
3.篩選出4個(gè)CRISPR Cas-9 sgRNA,pX335插入sgRNA4后,能促進(jìn)細(xì)胞的增殖。
4.下調(diào)FER1L4的水平后,PTEN的mRNA水平
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