植物基因的表達模式對序列結構和位點替代速率的影響.pdf

1、指導小組成員名單都柏林教授鄭偉謀研究員方海平研究員摘要自中性進化理論提出以來，進化生物學中關于隨機因禁還是自然選擇主導了進化歷史的爭論已經持續(xù)了40多年。實際上這是一個古老的阿題。隨機因素對于進化過程的影響早在達爾文那里就已經被注意到了。達爾文明確區(qū)分了三種不同類型的變異，即有利變異，有害變異和既無異也無害的變異。前兩類變異的保存都受到自然選擇的制約而第三類變異則在生物群體中“隨波逐流”，可能轉瞬即逝，也可能受環(huán)境的影響而固定下來。在偉

2、大的遺傳學家ThomasMorgan和群體遺傳學的奠基人之SewallWright那里，中性突變，或者遺傳漂變，則受到了更太的關注。然而，現代綜合進化論的巨大成功使得自然選擇在解釋進化歷史方面獲得了統(tǒng)治性的地位，基因突變唯一的作用就是向“造物主”自然選擇提供創(chuàng)造新的生物特征和新的物種的原材料，隨機因素則被擠在一個狹小的角落里，為自然選擇創(chuàng)造生命世界的偉大壯舉添磚加瓦或者誰4造雜音。自從DNA雙螺旋結構開啟分子生物學時代以來，利用DNA和

3、蛋白質序列研究進化過程和其機制的潮流已經蔚為牡觀，從根本上改變了進化領域里的研究方式，乃至科學結論。Kimura的中性進化理論使得隨機因素重煥生機。中性突變主導了序列水平的進化，自然選擇的重要性則日盞受到質疑。古生物學家Stt：phcnGould強烈批判了把生物性狀的一切改變都歸之于適應性進化的流俗觀點，而形象的把大多數性狀的出現比喻為羅馬天主教堂門廊的拱舟和方框之間被設計師無可奈何的留下的邊角。在初勰，中性突變理論受到了傳統(tǒng)進化生物學

4、家的強烈抨擊。綜合進化論的創(chuàng)始人之一ErDstMayr認為進化是一個受到太多的因素影響的太復雜太不確定的過程而無法簡單的用序列信息去重構逝去的歷史。自然選擇機制的存在性是無可置疑的，這是一個如此簡單而合理的邏輯。但是其起作用的范圍卻是值得討論的，這是這場曠日持久的爭論的焦點所在。在基因組的時代，大規(guī)?；蚪M注釋數據和功能數據為我們探索上述問題提供了更加豐富的素材。如果進化本身是一個多層次的過程，那么我們對它的理解也需要通過不同層次的研究