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文檔簡介
1、浙江大學碩士學位論文節(jié)旋藻分類學地位及生產性狀的分子標記研究姓名:黃暉申請學位級別:碩士專業(yè):生物物理學指導教師:汪志平20070501陣法構建系統(tǒng)樹時,先將16SrRNA、16S23SITS、23SrRNA和cpcHID操縱子4個基因串成一個4084bp的串聯(lián)序列,再分析品系間該序列的相似性與遺傳距離,進而構建出親緣關系樹。(3)用兩種方法構建的系統(tǒng)樹基本一致,整個系統(tǒng)樹分成界定明確的3大簇:第1簇由Sp1l單獨形成,第Ⅱ簇由Sp1、
2、Sp2、Sp6、Sp9、SpqO、81014和Spq8組成,第1II簇由Sp3、Sp4、Sp5、sp7、Sp一8、Sp15、sp16和Sp17組成。兩棵系統(tǒng)樹的主要差異在于第1I簇,超級矩陣法將該簇分成由Sp6、Sp14和Sp18組成的一個分支和spq、sp2、Sp9和Sp10組成的另一分支;而利用超級樹法,第n簇的所有品系組成同一支系。三、節(jié)旋藻生產性狀優(yōu)劣評價的若干分子標記在多年研究與生產實踐的基礎上,建立了4種能簡單、快速、有效初
3、步評價節(jié)旋藻生產性狀的分子標記技術。分別如下:(1)以節(jié)旋藻生產性狀差的第1類品系與生產性狀好的第n類品系,在16S23SrRNAITS中堿基位點有顯著共性差異、分別位于1~50bp和281~400bp的序列(稱為ITSMarkerl和ITSMarker2),作為生產性狀優(yōu)劣評價的分子標記。(2)以節(jié)旋藻生產性狀差的第1類品系與生產性狀好的第1I類品系,CpcI第1~80位氨基酸序列中第7、20、30、56和72位的共性差異,作為生產性
4、狀優(yōu)劣評價的分子標記。(3)以隨機引物$35和$99分別對生產性狀差的第1類和生產性狀好的第Ⅱ類節(jié)旋藻品系作RAPD擴增顯示出的特征性差異條帶為標記,評價節(jié)旋藻品系生產性狀的優(yōu)劣。即$35和$99的擴增條帶分別為900bp和650bp者,屬第1類品系;擴增條帶分別為680bp和900bp者,屬第1I類品系。(4)生產性狀差的第1類節(jié)旋藻品系的總DNA中只含1條exDNA,而生產性狀好的第1I類品系有2條exDNA,可以此作為分子標記評價
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