生物芯片掃描分析系統(tǒng)——嵌入式系統(tǒng)軟件設計.pdf

1、浙江大學碩上學位論文摘要生物芯片技術在疾病診斷、藥物篩選、基因測序等方面都有廣泛的應用前景，引起世界各國的廣泛關注和重視。生物芯片掃描分析系統(tǒng)是用來完成對雜交信號的強度進行快速、并行、高效的檢測和分析的系統(tǒng)√目前生物芯片的掃描和圖像l數(shù)據(jù)的處理分析分別是由成像裝置和臺式計算機來完成的，結構復雜，操作繁瑣，體積大，成本高，推廣困難。)r一■≯一一一近年來，嵌入式系統(tǒng)及其相關技術得到了快速的發(fā)展。嵌入式系統(tǒng)具有集成度高、體積小、專用性強、可

2、靠性高等特點，為生物芯片掃描分析系統(tǒng)提供了新的實現(xiàn)方法，應用嵌入式系統(tǒng)及其相關技術可以實現(xiàn)生物芯片掃描裝置和分析裝置的一體化。本文主要討論生物芯片掃描分析系統(tǒng)的嵌入式系統(tǒng)軟件設計。，f第一章介紹生物芯片、嵌入式系統(tǒng)、嵌入式Linux操作系統(tǒng)、嵌入式GuI的t發(fā)展與概況，闡述了生物芯片掃描分析系統(tǒng)應用嵌入式系統(tǒng)及其相關技術來實現(xiàn)的意義，并且提出課題研究工作的任務。第二章，由于生物芯片掃描分析系統(tǒng)需要對掃描的圖像做多種分析和處理，需要復雜的

3、用戶界面，這就要求GUI系統(tǒng)要有很強的圖形操作支持能力。在分析了若干種基于幀緩沖(FrameBuffer)的嵌入式GUI的實現(xiàn)、體系結構和特點的基礎上，設計了測試程序?qū)Ρ人鼈冊诜€(wěn)定性、繪圖速率等方面的性能，最終選擇Qt／Embedded作為嵌入式系統(tǒng)軟件開發(fā)平臺。第三章首先簡要敘述了生物芯片掃描分析系統(tǒng)的嵌入式系統(tǒng)硬件原理框圖，在此基礎上闡述了嵌入式系統(tǒng)軟件要實現(xiàn)的功能，然后對生物芯片掃描分析系統(tǒng)的嵌入式系統(tǒng)軟件設計進行了詳細敘述。對軟

4、件進行了深入分析和模塊劃分，細化模塊功能，具體設計與實現(xiàn)了各個模塊，討論了具體模塊實現(xiàn)中的若干問題?？紤]到嵌入式系統(tǒng)資源緊缺的特點，提出了高效的多線程模型。最后對本文的研究進行了總結，提出將來開發(fā)時需要改進和完善的功能。Ⅵ’／關鍵字：生物芯片、嵌入式GU[、Qt／Embedded、嵌入式Linux、多線程、嵌入__一，—～一一一一——一。～一。一～式數(shù)據(jù)』隼_●___一、浙江大學碩士學位論文11課題背景111生物芯片第一章緒論生物芯片(

5、biochip)[20】【21】[221是指采用光導原位合成或微量點樣等方法，將大量生物大分子(比如，核酸片段)生物樣品有序地固化于支持物(如玻片)的表面，組成密集二維分子排列，然后與己標記的待測生物樣品中靶分子雜交，通過特定的儀器(比如，激光共焦生物芯片熒光分析儀)對雜交信號的強度進行快速、并行、高效地檢測分析，從而判斷樣品中靶分子的數(shù)量。生物芯片技術在疾病診斷、藥物篩選f2l】、基因測序【22’等方面都有廣泛的應用前景，引起世界各國