LncRNA在前列腺增生性炎性萎縮向前列腺癌惡性轉化過程中差異表達的初步研究.pdf

1、分類號： 密級： U D C：學號：416523212194 南 昌 大 學 碩 士 研 究 生 學 位 論 文 LncRNA 在前列腺增生性炎性萎縮向前列腺癌 前列腺增生性炎性萎縮向前列腺癌 惡性轉化 惡性轉化過程 過程中差異表達 差異表達的初步 初步研究 研究 Differentially Expression of Long non-coding RNA

2、s in the Malignant Transformation from Proliferative Inflammatory Atrophy to Prostate Carcinoma: An Preliminary Study 郝 超 培養(yǎng)單位（院、系） ：南昌大學第一附屬醫(yī)院 指導教師姓名、職稱：王共先 教授 申請學位的學科門類：醫(yī)學 學科專業(yè)名稱：外科學（泌尿外） 論文答辯日期：2015 年 6 月 答辯委員會主席：

3、 評閱人： 2015 年 6 月摘要 II 摘 要 目的： 目的： 利用微陣列基因芯片技術檢測前列腺癌（PCa） 、前列腺增生性炎性萎縮（PIA）和癌旁非癌組織中差異表達的 mRNA 和 lncRNA。觀察前列腺惡性轉化過程中基因表達的動態(tài)變化，進而發(fā)現(xiàn)可能存在的前列腺非可控性炎癥至惡性癌變過程中的特征分子網(wǎng)絡，為 PIA→PCa 發(fā)病模式提供分子層面的新證據(jù)，以期為臨床前

4、列腺癌的預防、診療，以及發(fā)病機制提供新理論及新方案。 方法： 方法： 收集 2013 年 8 月至 2014 年 8 月我院前列腺切除術后臨床組織標本共 20 例，通過改進標本獲取方式，運輸途徑，破碎方法三方面因素，建立從離體組織標本提取高質量總 RNA 的方法。隨后在此方法基礎上，通過冰凍切片結合手工顯微切割技術在同一前列腺組織標本中分離出 PCa、 PIA 及癌旁非癌組織各區(qū)域的純凈細胞群。采用 lncRNA+mRNA 表達譜芯片

5、分析三者間的基因表達差異（生物學重復 3 次） ，通過生物信息學的方法篩選出具有顯著表達差異的 mRNA 和lncRNA，并對結果進行 Pathway 分析等初步的生物信息學分析，反向 Cis-預測lncRNA 的靶基因， 在發(fā)生顯著變化的炎癥和/或癌癥通路上建立 lncRNA 與靶基因的基因網(wǎng)絡圖。 結果： 結果： 1. 前列腺癌根治術后獲取的離體組織標本，在 30min 內(nèi)放入液氮凍存，經(jīng)液氮研磨或冰凍切片均可以提取到高質量的總 R

6、NA（RIN>7.5） 。 2. 手工顯微切割獲取的組織，可通過 Trizol 法提取到滿足高通量微陣列技術要求的高質量 RNA，但 H&E 染色會降低 RNA 的完整性。 3. 基因表達譜芯片的結果顯示： 人前列腺癌組織與癌旁非癌組織對照相比，有 2610 個 mRNA 表達有差異，其中上調 689 個，下調 1921 個；同時有 2176個 lncRNA 表達有差異，其中上調 688 個，下調 1488 個。人前列腺增