基因芯片檢測肺栓塞—深靜脈血栓形成相關基因群的研究.pdf

1、背景肺栓塞(Pulmonary embolism,PE)是臨床常見病,嚴重威脅著患者的健康和生命。肺栓塞和深靜脈血栓形成(Deep Venous thrombosis,DVT)是一種疾病的兩個不同階段,它是由于遺傳和/或環(huán)境異常造成的多基因、多因素疾病?，F(xiàn)已證實人體中存在著大量的基因突變、基因多態(tài)性、基因的差異表達與之有關。
　　 目的應用基因芯片技術研究PE患者和正常對照者的基因表達譜,分析PE相關基因,探討PE發(fā)生的分子遺傳

2、學機制。
　　 方法收集9例PE患者和33例正常對照的新鮮血樣,抽提、純化血樣總RNA。分別合成9個Cy3標記的PE患者cRNA探針和1個Cy5標記的標準對照探針,標準對照探針為所有正常對照者血樣混合cRNA組成。將9個PE患者Cy3-cRNA探針和1個標準對照Cy5-cRNA探針分別與44K Agilent人全基因組oligo芯片雜交。雜交后進行圖像掃描和數(shù)據(jù)分析,得到兩者間差異表達信息。并使用FQ-PCR對芯片實驗結果進行驗

3、證。
　　 結果9張芯片共篩選出共同差異表達基因434條。在Genebank登錄的有345條,其中表達上調(diào)基因286條,表達下調(diào)基因59條。這些基因涉及血液凝固相關基因、免疫炎癥相關基因、細胞分化凋亡相關基因、細胞生長維持相關基因、細胞信號和傳遞類相關基因、細胞骨架和運動基因、離子通道和運輸?shù)鞍最惢?、轉錄相關基因、RNA/DNA結合相關基因等。選取其中11條基因進行FQ-PCR擴增,結果證實所選基因在PE中均有差異表達,且與基