長非編碼RNA HOTAIR單核苷酸多態(tài)性與中國人群肝癌遺傳易感性.pdf

1、背景與目的:長鏈非編碼RNA HOTAIR是近幾年被發(fā)現(xiàn)的一類長度超過200 nt且不編碼蛋白質的RNA分子，在多種腫瘤組織中都呈現(xiàn)顯著性表達上調。HOTAIR能夠招募染色體重構復合物PRC2到指定的染色體位置，使得與腫瘤轉移相關的基因表達上調，從而促使腫瘤轉移的發(fā)生。本研究首次系統(tǒng)研究了HOTAIR基因座位功能性單核苷酸多態(tài)性(SNP)，及其與中國人群肝癌易感性的相關關系。
　　 方法:本研究首先通過生物信息學手段挑選中國人群

2、中HOTAIR基因的標簽SNP，進而采用病例-對照研究策略分析上述SNP與肝癌遺傳易感性的關系。在對性別和年齡匹配的肝癌病人和正常對照進行基因分型后，利用Logistic回歸分析來分析相關SNP與肝癌發(fā)生的相關關系。針對HOTAIR基因內(nèi)含子2區(qū)段基因表達調控區(qū)的一個SNP位點進行功能研究。設計克隆相關目的片段的PCR引物，將PCR產(chǎn)物連入T載體，雙酶切pGL3-Basic質粒和上述連接有目的片段的T載體質粒，回收相關DNA片段后，利用

3、T4連接酶連接，轉化后測序鑒定，進而利用定點突變試劑盒將質粒SNP位點突變成不同的基因型。之后，將野生型和突變型報告基因質粒分別轉染HepG2和SMMC-7721肝癌細胞后檢測其雙熒光素酶活性。
　　 結果與結論:HOTAIR基因在中國人群中存在3個標簽SNP，其中攜帶有CC基因型的rs920778與肝癌的發(fā)病風險具有相關性，相對于TT基因型使得肝癌發(fā)病風險增加了53％(OR=1.53，95％CI=1.02-2.29);位于內(nèi)含