偏最小二乘法在癌癥微陣列基因表達數(shù)據(jù)分析中的應用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、第二軍醫(yī)大學碩士學位論文偏最小二乘法在癌癥微陣列基因表達數(shù)據(jù)分析中的應用姓名：金志超申請學位級別：碩士專業(yè)：流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學指導教師：賀佳20090501第二軍醫(yī)大學碩士學位論文行比較，尋找差異表達基因選取方法、分類方法、成分數(shù)選擇的最佳組合?！窘Y果】①通過VIP值有效地提取差異表達基因；②利用VIP值篩選得到的差異表達基因結合Fisher精確檢驗能夠準確預測肝癌的細胞遺傳學異常區(qū)域，與傳統(tǒng)的實驗方法相比，在降低假陽性的情況下，識別效

2、率有了很大的提高：與CGMA相比較，靈敏度有了較大提高，和LSSCAP相比，本研究所用方法簡便快速，識別了5q(Oain)，17q(Loss)和21q(Loss)三個LSSCAP未識別區(qū)域，并且避免了兩個疑似假陽性區(qū)域15q(Gain)和22q(Loss)的識別；③兩種基于PLS的多分類方法在經過差異基因選取后都可以達到較好的分類效果，經不完全交叉驗證，VIP值法得到的差異表達基因對分類最有利，其值前200位基因和4個成分水平上兩種分類

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