實驗動物貴州白香豬母系及父系遺傳檢測.pdf

1、為了研究實驗用動物貴州白香豬的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳背景，本研究采用PCR測序技術(shù)對貴州白香豬 I系和II系30個個體線粒體 DNA D-loop區(qū)全序列和10個雄性個體 Y染色體上的SRY基因編碼區(qū)序列進行了序列測定，并結(jié)合GenBank上已發(fā)表的同源序列，進行了群體遺傳結(jié)構(gòu)及分子系統(tǒng)發(fā)育分析，得到如下結(jié)果：
　　1．貴州白香豬線粒體 D-loop區(qū)全長為1118、1128和1138bp三種不同長度。A、T、G、C堿基的平均含量分別為3

2、1.6％、24.7％、17.1％和26.6％，A＋T含量（56.3％）明顯高于G＋C含量（43.7％）。D-loop區(qū)核苷酸多樣性（Pi）為0.00119，平均核苷酸差異數(shù)（k）為1.333。
　　2．貴州白香豬兩品系的30個個體共檢測到3種線粒體單倍型，GZWXI8、GZWXI12和GZWXII230。I系15個被檢測個體占有全部這三種單倍型，II系15個被檢測個體只占有其中的一種單倍型 GZWXII230。在30個個體中，有4

3、個個體共享單倍型 GZWXI12，10個個體共享單倍型 GZWXI8，16個個體共享單倍型GZWXII230，其中包含1個I系個體。
　　3．貴州白香豬 II系15個被檢測個體當中只存在1種線粒體單倍型 GZWXII230。I系116號個體共享單倍型 GZWXII230，這與II系豬是從 I系豬當中選育出來的培育事實相符。I系豬中檢測到較多單倍型，需進一步選育提純。
　　4．I系、II系豬線粒體 D-loop序列與GenBa

4、nk上收錄的49個豬品種同源序列比對，檢測到42個多態(tài)位點，界定了57種單倍型。貴州白香豬的兩個品系與中國其它地方豬品種沒有共享單倍型，說明貴州白香豬在母系遺傳上具有獨特的遺傳結(jié)構(gòu)。
　　5．通過進一步系統(tǒng)發(fā)生育分析，從構(gòu)建的NJ系統(tǒng)樹和UPGMA系統(tǒng)樹來看，57種單倍型可分為A、B兩大類型：以中國豬種單倍型為主的A類和以歐洲豬種單倍型為主的B類。貴州白香豬處于A類，并單獨聚為一小類。
　　6．本研究還檢測了國內(nèi)外14個家豬

5、品種（類群）及中國野豬，共計75個雄性個體的Y染色體 SRY基因，結(jié)果表明該基因編碼區(qū)序列長為711bp，檢測到6個多態(tài)位點，界定了6種單倍型。貴州白香豬 I系和II系的10個樣本在SRY基因編碼區(qū)未觀察到核苷酸序列變異。與國內(nèi)其它地方豬品種、5頭中國野豬的SRY基因同源序列進行比對，除個別個體有差異外，絕大多數(shù)個體共享1種單倍型 GZWXI，表明中國家豬具有共同的父系起源。
　　7．約克夏（Yorkshire）、杜洛克（Duro