利用SSR標記分析玉米自交系的遺傳多樣性.pdf

1、種質資源的遺傳多樣性評價及種質間遺傳關系研究是玉米育種研究的重要內容.本文采用SSR分子標記技術,以6個國內和6個CIMMYT自交系為標準測驗種,分析了我國玉米生產(chǎn)上廣泛應用的119個早熟自交系玉米的遺傳多樣性,并整合了我國常用的其它自交系玉米的SSR檢測數(shù)據(jù),初步構建了包含375個玉米自交系的SSR指紋數(shù)據(jù)庫. 1.70對SSR引物在119個早熟自交系和12個標準測驗種中共檢測出285個等位基因變異,每對引物檢測出2-8個等位

2、基因,平均4.07個,多態(tài)性信息量(PIC)范圍從0.18到0.81,平均0.58.119個早熟和12個標準測驗種共131個自交系間的遺傳相似系數(shù)(GS)在0.50-0.94之間,平均0.68.利用UPGMA方法將119個早熟自交系劃分為四平頭、旅大紅骨、PA、PB、:BSSS、Lancaster等6個類群,劃群結果與其系譜分析基本相符. 2.基于相同的標準測驗種、引物和統(tǒng)一規(guī)范的檢測方法,整合了本實驗室肖木輯博士(2006)分

3、析189個我國常用玉米自交系遺傳遺傳多樣性時獲得的SSR檢測數(shù)據(jù),初步構建了包含375個玉米自交系的SSR指紋數(shù)據(jù)庫.70對SSR引物在375個自交系中共檢測出291個等位基因變異,每對引物檢測出2-8個等位基因,平均為4.2個,多態(tài)性信息量(PIC)范圍從0.16到0.88,平均0.60.375個自交系間遺傳相似系數(shù)(GS)范圍在0.30-0.98之間,平均0.64..利用LIPGMA、主坐標、ME、遺傳結構等分析方法將375個自交系

4、劃分為四平頭、旅大紅骨、PA、PB、BSSS、Lancaster等6個類群.連鎖不平衡(LD)分析表明70個SSR位點在全基因組范圍存在廣泛的連鎖不平衡. 3.針對70位點在375個自交系中檢測結果獲得的遺傳相似系數(shù)矩陣進行標準誤和相關性分析,結果表明用于供試自交系遺傳多樣性分析使用的SSR引物數(shù)應不少于40個,獲得的等位基因數(shù)應不少于180個.比較分析了不同來源標準測驗種的SSR檢測結果,認為12個標準測驗種具有較好的穩(wěn)定性和