一株O型口蹄疫病毒分離株的全基因序列分析.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、本文對(duì)一株O型口蹄疫病毒分離株的全基因序列進(jìn)行了分析。本研究以牛FMDV分離株HLJOC12/03細(xì)胞培養(yǎng)毒為材料，提取病毒總RNA，以提取的RNA為模板，根據(jù)參考序列設(shè)計(jì)合成特異性引物，通過RT-PCR方法獲得了此株病毒基因組的核苷酸序列，并將其克隆到pMD18-T載體上，轉(zhuǎn)化宿主菌TGl感受態(tài)細(xì)胞中，經(jīng)PCR、酶切鑒定以及測(cè)序證明得到了此株病毒各段基因。利用DNAStar軟件包中的SepMan軟件進(jìn)行序列拼接，基因組測(cè)得的5’非編碼

2、區(qū)(5'UTR)長(zhǎng)1052個(gè)核苷酸(nt)，IRES長(zhǎng)455nt；L編碼區(qū)基因長(zhǎng)603nt，編碼201個(gè)氨基酸(aa);P1編碼區(qū)基因長(zhǎng)2002nt，編碼734aa; P2編碼區(qū)基因長(zhǎng)1470nt，編碼490aa;P3編碼區(qū)基因長(zhǎng)2721nt，編碼907aa;3’LJTR從TAA始至poly(A)前長(zhǎng)93nt，所測(cè)出poly(A)尾長(zhǎng)度為16nt；由此本毒株已測(cè)得基因長(zhǎng)為8158nt，編碼區(qū)長(zhǎng)6999nt，編碼2332aa，將所得序列與

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