應用寡核苷酸芯片檢測非小細胞肺癌遺傳易感相關的代謝酶基因多態(tài)性.pdf

1、山東省醫(yī)學科學院碩士學位論文應用寡核苷酸芯片檢測非小細胞肺癌遺傳易感相關的代謝酶基因多態(tài)性姓名：劉群申請學位級別：碩士專業(yè)：腫瘤學指導教師：王哲海20080301山東省醫(yī)學科學院碩士學位論文國內外大量研究運用DNA澳fJ序法、聚合酶鏈一限制性長度多態(tài)性(PCR—RFLP)等方法檢測這些代謝酶基因的SNP，進而分析它們與NSCLC易感性的關系。近年來芯片技術以其快速、高效、并行、高通量等優(yōu)點逐漸應用于多基因多位點SNP的檢測。本研究采用寡

2、核苷酸芯片技術檢澳dNSCLC患者代謝酶基因CYPlAlml、m2位點和GSTMl的基因多態(tài)性，通過DNA測序驗證該技術用于檢i貝tJSNP的可行性；并分析這三種SNP與NSCLC易感性的關系及它們與環(huán)境因素之間、多SNP之間的相互聯系。方法2006年1月至2007年5月，病例組為山東省腫瘤醫(yī)院就診的NSCLC患者110例，均經細胞學或組織病理學確診且未經放射、化學治療，其中鱗癌68例(618％)，腺癌31例(282％)，其他類型1l例

3、(10％)，中位年齡581歲。對照組為醫(yī)院健康體檢者125例，中位年齡592歲。兩組均為山東漢族人，性別、年齡采用頻數配對，并以問卷形式收集研究對象的人口學資料、吸煙史、職業(yè)史等。采集2組外周血標本2ml，應用Fastagen公司血標本DNA提取試劑盒按照操作步驟提取外周血DNA。根據Genebank數據庫的序列資源設計寡核苷酸探針，制備芯片，將提取的DNA通過PCR擴增出靶序列與芯片雜交，通過Scanarray4000掃描并讀取雜交結

4、果。利用DNA測序法鑒定芯片的檢測結果。應用SPSSl30軟件進行數據統(tǒng)計分析，以)C2檢驗對不同基因型之間的差異進行分析，用非條件Logistic回歸模型計算比值比(oddsratios，OR)及其95％可信區(qū)間(confidenceintervals，CI)，全部檢驗均為雙側檢驗，P005)。31lO例NSCLC中，CYPIAI基因m2位點IIe／IIe、IIe／Val和Val／Val基因型分布頻率為1636％、7273％和i091