基因芯片平臺的建立及在APL細胞分化研究中的應用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、為了更好地在轉(zhuǎn)錄組水平研究疾病的發(fā)病機制,我們建立了cDNA基因芯片技術平臺,現(xiàn)在已有12,630個克隆,已知基因有9,436個.在平臺的質(zhì)量上,片內(nèi)和片間的信號強度的相關系數(shù)達到0.95,且芯片的結(jié)果與實時定量RT-PCR的結(jié)果一致性好,說明我們的平臺是穩(wěn)定的可靠的平臺.為了進一步研究維甲酸誘導分化的機制該文應用cDNA基因芯片技術,結(jié)合自組成圖(SOM)與成分平面展示等生物信息手段,分析了藥理濃度的ATRA誘導NB4細胞分化不同時相

2、(6h、12h、24h、和48h)的基因表達譜.該文著重分析了C/EBP家族和bHLH家族的轉(zhuǎn)錄因子的變化情況,C/EBPα在ATPA作用后表達略微上升,隨著向粒系終末分化表達發(fā)生了下降,而C/EBPβ和C/EBPε在ATPA作用后表達持續(xù)上升,它們變化的不同與這些C/EBP蛋白行使的功能不同相一致.綜 上所述,在藥理濃度ATRA作用下,APL細胞中的維甲酸受體通路重新被激活,許多基因的表達發(fā)生了變化,這些基因形成了一個復雜且有序的調(diào)控

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