核rDNA ITS序列在側(cè)耳屬分子分類學(xué)上的應(yīng)用.pdf

1、側(cè)耳屬是一類廣為分布的且具有食(藥)用價(jià)值的木腐生真菌，種類較多，分類較為混亂。本文利用PCR產(chǎn)物克隆測(cè)序測(cè)定了側(cè)耳屬7個(gè)種和中國(guó)各地區(qū)栽培的11個(gè)側(cè)耳品種以及外群黑木耳的核rDNAITS(內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū))序列，另外從GenBank獲得23個(gè)側(cè)耳種與外群亞側(cè)耳的ITS序列。運(yùn)用Bioedit與Phylip軟件對(duì)所獲得的ITS序列進(jìn)行分析，構(gòu)建了側(cè)耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹及我國(guó)各地區(qū)側(cè)耳品種的親緣關(guān)系樹，獲得了各供試側(cè)耳之間的平均遺傳距離，研究了供試

2、側(cè)耳的分類及系統(tǒng)親緣關(guān)系?，F(xiàn)將實(shí)驗(yàn)結(jié)果報(bào)告如下： 1.供試側(cè)耳的ITS區(qū)(含ITS1，5.8SrDNA和ITS2)序列的長(zhǎng)度范圍為627-667bp，比對(duì)(alignment)后長(zhǎng)度為731bp，變異位點(diǎn)為317個(gè)，信息位點(diǎn)為247個(gè)；其中，ITSl和ITS2的長(zhǎng)度范圍分別為225-266bp和228-262bp，變異位點(diǎn)分別為176個(gè)和139個(gè)，信息位點(diǎn)分別為142個(gè)和103個(gè)；5.8SrDNA長(zhǎng)度范圍為155-158bp，變

3、異位點(diǎn)為4個(gè)，信息位點(diǎn)為2個(gè)。 2.以亞側(cè)耳作為外群，利用MP(最大簡(jiǎn)約法)構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹及它們之間的平均遺傳距離表明：供試材料中已定種名的30個(gè)側(cè)耳可以分為六組：第一組包括P.abieticola、P.fossulatus、刺芹側(cè)耳、白阿魏蘑、楊側(cè)耳、P.subarelatus、P.albitus、阿魏蘑、灰白側(cè)耳、哥倫比亞側(cè)耳、鳳尾菇、佛羅里達(dá)側(cè)耳和糙皮側(cè)耳。第二組含P.australis、美味側(cè)耳、肺形側(cè)耳和P.oput

4、iae。第三組含紅側(cè)耳、P.incarnatus、扇形側(cè)耳和貝蓋側(cè)耳，它們之間具有非常近的親緣關(guān)系。第四組含P.euosmus、黃白側(cè)耳和金頂側(cè)耳。第五組含囊蓋側(cè)耳、P.fusscosquamulosus、P.smithii和櫟側(cè)耳。第六組有P.javanicus與具核側(cè)耳，這兩者與其它側(cè)耳的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。其中金頂側(cè)耳與黃自側(cè)耳、佛羅里達(dá)側(cè)耳與糙皮側(cè)耳、紅側(cè)耳與P.incarnates、灰白側(cè)耳與哥倫比亞側(cè)耳為同一個(gè)種兩個(gè)不同的名稱；白

5、阿魏蘑與刺芹側(cè)耳和阿魏蘑有較密切的親緣關(guān)系，但它們不是同一個(gè)種。而肺形側(cè)耳與鳳尾菇關(guān)系很遠(yuǎn)，應(yīng)屬于兩個(gè)不同的種。 3.以黑木耳作為外群，利用MP(最大簡(jiǎn)約法)構(gòu)建的親緣關(guān)系樹及它們之間的平均遺傳距離表明：我國(guó)各地區(qū)主要栽培的側(cè)耳品種按親緣關(guān)系可分為五大組：第一組包括鳳尾菇、灰白側(cè)耳、佛羅里達(dá)側(cè)耳、糙皮側(cè)耳、緣刺側(cè)耳、平802、日本秀珍和姬菇。其中糙皮側(cè)耳與佛羅里達(dá)側(cè)耳為同一個(gè)種，日本秀珍、緣刺側(cè)耳及姬菇都為哥倫比亞側(cè)耳下的栽培品

6、種。第二組含杏孢菇、香側(cè)耳、白阿魏蘑、刺芹側(cè)耳、阿魏蘑，其中杏孢菇即刺芹側(cè)耳與香側(cè)耳具有非常近的親緣關(guān)系，白阿魏蘑與白靈菇為同一個(gè)種兩個(gè)不同的名稱，而且杏孢菇、白靈菇與阿魏蘑之間有比較密切的親緣關(guān)系。第三組含平963-1、楊側(cè)耳。平963-1與楊側(cè)耳親緣關(guān)系較近，但不能確定它是否屬于楊側(cè)耳。第四組含平側(cè)5、平8804、小白平菇、美味側(cè)耳、肺形側(cè)耳，其中平側(cè)5和小白平菇是美味側(cè)耳種下的栽培種。第五組含榆黃蘑、雞汁菌、黃白側(cè)耳，這三者之間具