10300.abeem7p浮動電荷模型下液態(tài)水的動力學模擬

1、分類號：密級：學校代碼：學號：連掌師耗大學10165201311000791碩士學位論文⑨ABEEM一7P浮動電荷模型下液態(tài)水的動力學模擬作者姓名：學科、專業(yè)：研究方向：導師姓名：劉爽原子與分子物理生物分子結構與性能楊忠志教授2016年4月遼寧師范大學碩士學位論文摘要應用ABEEM7P水分子模型，對由216個和500個水分子構成的液態(tài)水體系，使用周期性邊界條件，在NVT、NPT系綜下，進行分子動力學模擬。在前人的基礎上研究相同的溫度弛豫

2、時間f，=001ps，壓力弛豫時間分別為r，=20ps、f，=25ps、r，=30ps、“Cp=40ps時，不同水分子體系中，氧原子上的孤對電子功與氫原子H間的距離在小于何值時開始形成氫鍵，對分子動力學模擬性質的影響，距離分別為18A、19A、20A、21A、22A和23A。分析數據，密度隨氫鍵形成距離的增加而增加，隨著壓力弛豫時間f。的增加而增加。壓力在目標壓力1atm附近上下波動，而偶極矩隨壓力弛豫時間f。增大而減小，隨氫鍵形成距離

3、增加而增加。500水分子體系模擬得到的性質明顯好于216個水分子體系。改變水盒子的初始盒長，216個水分子體系的密度隨著初始盒長的增加有減小的趨勢。當初始盒長不超過21cm時，對壓力的影響較小，壓力值在latm附近波動。初始盒長超過21cm時，偶極矩逐漸增加。由于模擬數據較少，還需我們進行下一步模擬。基于上述研究結果，為了更加體現ABEEM7P浮動電荷模型的有點，選擇進一步計算AMBER力場下的動力學性質。分別計算壓力弛豫時間印=20p

4、s、f，=25ps、r。=30ps、f，=40ps情況下的動力學性質。AMBER力場的密度隨著溫度的增加而逐漸減小，ABEEM計算得到的密度隨溫度的變化更為接近實際情況下的水體系，并且隨著壓力弛豫時間r。的增加而增加。相比之下，AMBER固定電荷力場計算得到壓力偏差小于ABEEM7P水分子模型。但是從整體上來說，ABEEM力場模擬得到的性質與實驗值有很好的一致性。上述結果為日后的研究提供一定的參考。關鍵詞：ABEEM7P!液態(tài)水；分子動