水稻條紋病毒及其介體灰飛虱的遺傳多樣性.pdf

1、水稻條紋病毒(Rice stripe virus,RSV)是一種灰飛虱(Laodelphax striatellus)傳播的重要水稻病毒,在中國廣泛分布.該文分別對RSV及采自病害發(fā)生地或非發(fā)生地的介體灰飛虱的自然種群進行遺傳變異分析.對來自中國7個地理種群的灰飛虱的18S rRNA基因和第一內轉錄間隔區(qū)(ITS1)進行了SSCP及序列分析,結果表明灰飛虱的18S rRNA基因和ITS1在種內非常保守.對常見的褐飛虱(Nilaparva

2、talugens)、白背飛虱(Sogatellafurcifera)和黑尾葉蟬(Nephotettixcincticeps)進行了PCR擴增.應用PCR技術成功獲得了灰飛虱rDNA上的基因間隔區(qū)(IGS)的序列.序列分析表明,IGS區(qū)的AT含量為59％-60％間,高于18S rDNA的含量但略低于ITS1的含量;序列預測顯示該序列含有CAATbox和TATAbox.進一步對來自中國云南、江蘇的7個地理種群灰飛虱進行分析.用正交實驗對灰飛

3、虱的RAPD的反應體系進行了優(yōu)化,并對牛血清白蛋白(BSA)的作用進行了探討.結果表明BSA對灰飛虱的RAPD擴增結果具有明顯改善作用.對來自云南的保山、大理、楚雄、西山、昆明和江蘇的洪澤、南京等7個地理種群的灰飛虱進行RAPD分析,結果表明不同種群的灰飛虱存在著遺傳差異,遺傳距離在0.15-0.30間,與地理來源沒有明顯的相關性.對1998-2003年RSV的43個分離物的外殼蛋白(CP)基因進行變異分析,結果表明在RSV自然種群中不

4、僅不同地理來源的分離物間存在著變異,而且同一地理來源的不同分離物間及單一分離物內都存在著變異.在這些變異中,都是堿基替換,而沒有堿基的插入或缺失,遺傳多樣性值為0.03449.根據(jù)序列同源性可以把這些分離物分為云南和云南以外分離物的兩組,其中日本分離物也可以單獨分開,這說明了RSV的變異與地理分布具有一定的相關性.CP基因的非同義和同義替代的比值為0.092,這暗示了氨基酸的改變受到了負選擇壓力的限制.此外,同一地理來源的不同年份分離物