10507.小菜蛾不同發(fā)育時期rna編輯位點的識別與驗證_第1頁
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文檔簡介

1、IillIlllIIIillIIIIIIIIIIilLllIlllIIILIIY2974941IDENTIFICATIONANDEXPERIMENTALVALIDATIONOFRNAEDITINGSITESINDMONDBACKMOTHbyLEIWENJIEAThesisSubmittedtoNanjingAgriculturalUniversityinPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheM

2、asterDegreeofAgricultureScienceSupervisedbyProfLiFeiDepartmentofEntomologyCollegeofPlantProtectionNanjingAgriculturalUniversityNanjing210095PRChinaMav2014目錄目錄摘要IABSTRACTIH第一章文獻綜述111小菜蛾112RNA編輯的研究進展2121RNA編輯2122基于第二代測序技術的

3、RNA編輯研究3第二章小菜蛾RNA編輯位點的識別721數(shù)據與計算方法8211數(shù)據庫及軟件一8212基因數(shù)據一8213序列比對及軟件參數(shù)設置822結果9221小菜蛾RNASeq比對結果9222構建潛在的RNA編輯位點集9223對潛在的RNA編輯位點集篩選過濾一，D1)濾除落在3’、5’端位點，J2)濾除來自同庫的重復序列J23)濾除編輯效率低及覆蓋度過低的位點J24)濾除替換類型不確定的編輯位點門5)濾除剪接位點周圍的RNA編輯位點J36

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