18582.一、二價金屬離子與氮甲基乙酰胺、水分子的相互作用的理論研究_第1頁
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1、分類號:密級:學校代碼:學號:遣掌師籠大擎10165201211000950碩’士學位論文一、二價金屬離子與氮一甲基乙酰胺~水分子的相互作用的理論研究作者姓名:學科、專業(yè):研究方向:導師姓名:李偉波物理化學理論與計算化學宮利東教授20l5年4月遼寧師范大學碩士學位論文摘要金屬離子的重要性及其在化學和生物中的多樣性是毋庸置疑的,例如Li、Na、K、Be2、M92和Ca2在許多生物化學體系中起很重的作用。為了更好地了解金屬在生物體內的生物功

2、能,探索金屬離子與生物大分子之間的相互作用非常重要。本文應用量子化學方法對上述六種金屬離子與氮甲基乙酰胺0m【A)以及與水的相互作用進行理論研究。并以量子化學方法的計算結果為依據(jù),應用原子鍵電負性均衡浮動電荷力場模型(ABEEMo“a:/MM)研究了M(NMA)。、M(H20)。(i=36)以及M(NMA)(I120)朋(M=Na,K,M92,Ca2;nm=3、4、6)體系的結構、能量等性質。首先,對M(NMA)一(M=Li,Na,K,

3、Be2,M92,Ca2;薩l~6)體系分別采用MP2方法和B3LYP、B3PW91、M062X三種密度泛函方法在631G(d,P)基組下進行結構優(yōu)化,并計算最穩(wěn)定結構的振動頻率,比較不同NMA配位數(shù)下幾何結構,結合能,電子結構等性質。然后對MP2方法得到的穩(wěn)定結構,采用較高水平的基組MP2/631l舶(2d,2p)方法進行能量計算。我們注意到,每增加一個NMA分子,金屬與NMA團簇中羰基氧的距離尺舯變大,內層NMA上的羰基鍵長犬c=0逐

4、漸變?。贿B續(xù)結合能降低;金屬離子上所帶的電荷隨NMA分子數(shù)增加而減??;。在ABEEMaTdMM模型下,以從頭算HF/STO3G方法的Mulliken電荷為基準,重新擬合了Na、K、M92以及Ca2的ABEEM參數(shù),并且構建了描述金屬離子與NMA及金屬離子與水分子間相互作用的勢能函數(shù),利用該函數(shù)計算了M(NMA)。和M(H20)。(玎=3“)體系的結構、電荷及結合能。與量子化學方法的計算結果相比,金屬離子與氧的距離滅M旬平均絕對偏差小于0

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