水稻強分蘗基因stl的分子定位研究.pdf

1、該研究從粳稻(Oryza sativa Lsubsp.japonica)中花11號經0.1％EMS處理的后代中獲得一份強分蘗突變體材料"多蘗",其最顯著生長特征是分蘗速度快,分蘗旺盛,莖蘗細而多,葉片細長,矮生.以突變體多蘗為母本與Dular進行雜交,獲得雜交F<,1>及F<,2>.對它們的莖蘗數進行系統(tǒng)調查發(fā)現,F<,1>代表現為正常分蘗,F<,2>代分蘗性狀發(fā)生分離,F<,2>代群體共調查738株,其莖蘗數次數分布表現為連續(xù)變異的雙

2、峰分布,且兩峰值分別與兩親本的莖蘗數相近,以兩峰之間的最低值為界限進行分組,形成正常分蘗株(1~39個/株)和強分蘗株(39~72個/株)兩個集團,其中莖蘗數為39~72個的有170株;莖蘗數為1~39個的有568株.正常株與強分蘗株的比例符合1對基因的分離比例3:1(χ<,c><'2>=1.4164<χ<,0.05,1><'2>=3.84),說明強分蘗突變性狀受1對隱性基因控制.利用多蘗與Dular雜交產生的F<,2>群體對此強分蘗性

3、狀的隱性基因進行了精細定位.該基因首先被定位在水稻第1染色體上微衛(wèi)星標記SSR149和RM297之間,遺傳距離分別是0.80cM,3.10cM.對照已有的連鎖圖,可以推斷出強分蘗基因stl位于水稻第1染色體長臂的中下部,文獻檢索結果發(fā)現,第1染色體此位置上沒有類似的基因,表明該基因為一新強分蘗基因,將該基因暫定名為stl(strongtillering).為了進一步定位stl基因,利用已經公布的水稻基因組序列在stl基因附近區(qū)域尋找微衛(wèi)

4、星序列并發(fā)展新的標記,在RM297和SSR149之間發(fā)展了4個有多態(tài)的微衛(wèi)星標記SSR-1-27、SSR-1-24、SSR-st3和SSR-st4,以及初步定位表現為共分離的SSR261、SSR227對精細定位群體進行檢測后發(fā)現,stl位于SSR-1-27與SSR261之間,與前者相距0.30cM,與后者約距0.05cM,而與SSR-1-24、SSR-st3、SSR-st4表現為共分離.以此為基礎,構建了覆蓋stl基因區(qū)域的BAC重疊群