藍(lán)點(diǎn)馬鮫和日本鳀的遺傳多樣性研究.pdf

1、通過(guò)PCR擴(kuò)增和序列測(cè)定等技術(shù),對(duì)分布于黃、東海海域的魚(yú)蝦鳀魚(yú)(Engraulis japonicus的ITS-1基因片段及線(xiàn)粒體DNA的16S rRNA、Cytb和CoI基因片段進(jìn)行初步的研究,分別得到大小約為400bp、550bp、400bp和650 bp的片段.通過(guò)序列比較發(fā)現(xiàn)Coi基因片段長(zhǎng)度適宜,變異位點(diǎn)適中,且易于擴(kuò)增,因此適合用于進(jìn)行群體內(nèi)及群體間的遺傳多樣性分析.該研究進(jìn)一步對(duì)分布于黃、東海海域不 地理群體的鳀魚(yú)mtDN

2、A CoI基因片段進(jìn)行了PCR擴(kuò)增和測(cè)序.用Genedoc軟件進(jìn)行序列比較,在這45個(gè)個(gè)體中未發(fā)現(xiàn)堿基插入或缺失,共檢測(cè)到45個(gè)變異位點(diǎn),其中有43個(gè)轉(zhuǎn)換位點(diǎn)和2個(gè)顛換位點(diǎn).運(yùn)用MEGA軟件計(jì)算出不同個(gè)體間的遺傳距離,并據(jù)此構(gòu)建了UPGMA和NJ系統(tǒng)樹(shù).用DNASP軟件計(jì)算出各個(gè)群體及總?cè)后w的多態(tài)位點(diǎn)數(shù)(S)、核苷酸多樣性(P<,i>)和平均核苷酸差異數(shù)(K).發(fā)現(xiàn)三個(gè)群體的45個(gè)個(gè)體隨機(jī)分布,沒(méi)有明顯的聚類(lèi)現(xiàn)象,且群體內(nèi)的遺傳多樣性參