基于rDNA序列研究土生空團菌的遺傳多樣性.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、土生空團菌（Cenococcum geophilum Fr.）是一種重要的外生菌根真菌，具有突出的抗旱性。其地理分布和寄主范圍都非常廣泛。目前，國內關于土生空團菌遺傳多樣的研究還很少，因此，本文對35個中國菌株和4個法國菌株的rDNA ITS區(qū)域和18S、28S rDNA中I型內含子進行測序，結合GenBank的相關數(shù)據(jù)，分析其核苷酸序列差異和RNA二級結構特征，進一步研究影響土生空團菌遺傳分化的因素。主要結果如下：
　　1、土生

2、空團菌rDNA ITS區(qū)序列長度為422bp~447bp，顯示出93.8%~100%的同源性。其中ITS1和ITS2區(qū)均可形成穩(wěn)定的RNA二級結構，表明它們在rRNA轉錄后加工中發(fā)揮著作用。系統(tǒng)發(fā)育分析表明每個地區(qū)的土生空團菌都有一定的遺傳多樣性；其中聚在一起的菌株基本來源于相同地理區(qū)域，而菌株的親緣關系與寄主沒有明顯相關性。
　　2、34個中國土生空團菌有22個菌株在18S rDNA中有I型內含子。序列分析表明18S rDNA中

3、的I型內含子序列長度為488bp~590bp。其5’端序列比較保守，3’端序列有差異。二級結構顯示I型內含子有10個配對區(qū)（P1~P10），P5區(qū)域由P5，P5a，P5b，P5c，P5d組成，P9的3’端有2個配對區(qū)（P9.1、P9.2）。系統(tǒng)發(fā)育分析表明每個地區(qū)的土生空團菌有一定的遺傳多樣性；其中遺傳多樣性和地理區(qū)域有很大的關系，和寄主沒有明顯相關性。
　　3、34個中國土生空團菌有21個菌株在28S rDNA中有I型內含子。2

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