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文檔簡介
1、MicroRNA(miRNA)是由約22個核苷酸組成的內源性非編碼小分子RNA,廣泛存在于真核細胞中。多項研究表明,miRNA在植物-病原物互作過程中起著至關重要的調控作用。番茄是常見的經(jīng)濟作物,世界各地均有大面積種植,由致病疫霉引起番茄晚疫病常給番茄生產(chǎn)造成嚴重損失。隨著miRNA研究技術的不斷完善,高通量測序技術因其獨特的優(yōu)勢逐漸被廣泛應用于miRNA的挖掘中。miR396是植物中特有的一類保守miRNA,雖有文獻證明其在番茄中存在
2、,但目前仍沒有關于它在番茄中功能特性的研究報道。因此,基于上述研究需要,本研究利用高通量測序方法構建了2個番茄小RNA文庫,并分析了miR396在番茄抗病抗逆中的作用。
首先,本研究通過高通量測序方法構建了致病疫霉誘導下的2個番茄小RNA文庫,獲得了230個已知和67個新的miRNA;差異表達分析顯示118個miRNA在致病疫霉侵染下表達量變化明顯;隨后又采用實時定量PCR驗證了11個miRNA的表達。靶基因預測及分析表明這些
3、miRNA參與植物-病原物互作過程。
其次,本研究從構建的文庫中挑選出可能與抗病相關的miR396,通過生物信息學方法分析了番茄miR396的特性并采用實時定量PCR分析了它在致病疫霉、激素、高鹽、干旱脅迫下的表達特性。結果表明,miR396均能對上述脅迫條件作出響應,并在致病疫霉處理下變化最為明顯。
為進一步了解miR396的功能特性,本文從番茄中克隆了MIR396基因,并且構建了相應的植物表達載體。miR396在
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