碩士論文——規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化研究_第1頁
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文檔簡介

1、<p><b>  學(xué) 位 論 文</b></p><p>  規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)</p><p><b>  可視化研究</b></p><p>  學(xué)位授予單位:河北工業(yè)大學(xué)</p><p><b>  答辯委員會(huì)主席:</b></p>&

2、lt;p><b>  評(píng)閱人:</b></p><p> 指導(dǎo)教師姓名: 教授 河北工業(yè)大學(xué)</p><p> 申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩 士學(xué)科、專業(yè)名稱: 精密儀器及機(jī)械</p><p> 論文提交日期: 論文答辯日期: </p><p>  河北工業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文</p><p>

3、;  規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化研究</p><p><b>  摘要</b></p><p>  本論文針對(duì)醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù),從科學(xué)可視化的角度出發(fā),通過分析大量文獻(xiàn),重點(diǎn)研究了水平集的分割算法和基于分割的三維重建方法。論文所做的主要工作及創(chuàng)新成果包括:</p><p>  討論了規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)、醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化分割和三維重建技術(shù)的相關(guān)概念,分析

4、了當(dāng)前國內(nèi)外的發(fā)展情況。</p><p>  對(duì)水平集分割進(jìn)行研究,提出了水平集的快速行進(jìn)法和窄帶法相結(jié)合的圖像分割算法,從規(guī)則的醫(yī)學(xué)圖像中準(zhǔn)確地提取出目標(biāo)組織器官,為接下來的三維重建做基礎(chǔ);與此同時(shí),根據(jù)感興趣區(qū)的特性和其所處的環(huán)境合理選取種子點(diǎn),解決分割中對(duì)種子選取的瓶頸問題。</p><p>  根據(jù)規(guī)則的醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù),利用本文提出的分割方法,研究了基于分割的改進(jìn)的</p>

5、<p>  Marching Cubes 方法和基于顏色填充的光線投影體繪制方法,用實(shí)驗(yàn)表明,比傳統(tǒng)的重建方法具有較高的可視化效果。</p><p>  仔細(xì)研究了國內(nèi)外正在普遍使用的 VTK(Visualization Toolkit) 和 ITK(insight segmentation and registration Toolkit)開發(fā)工具包,并用 VC++2005 實(shí)現(xiàn)了我們提出的分割算

6、法和三維重建方法,給出關(guān)鍵代碼。</p><p>  用規(guī)則醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù),在 Windows 平臺(tái)上,結(jié)合 ITK、VTK 研究出一套簡單的醫(yī)學(xué)可視化系統(tǒng),該系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)了三維顯示、二維分割、虛擬切片顯示、人機(jī)交互等功能,具有一定的后續(xù)研發(fā)參考價(jià)值。</p><p>  關(guān)鍵詞:醫(yī)學(xué)可視化,圖像分割,三維重建,VTK,ITK,虛擬切片</p><p><b> 

7、 i</b></p><p>  規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化研究</p><p>  RESEARCH ON VISUALIZATION OF THE</p><p>  REGULAR THREE-DIMENSIONAL</p><p>  MEDICAL VOLUME DATA</p><p>&

8、lt;b>  ABSTRACT</b></p><p>  This paper mainly studies the segmentation algorithm of Level Set and 3D reconstruction method for medical volume data through the analysis of lots of documents, which f

9、rom the perspective of scientific visualization. The main work and the innovative achievements include:</p><p>  Discussing the related concepts of the regular data sets, the visualization of medical data se

10、gmentation and 3D reconstruction technology, analysis of the current developments at home and abroad.</p><p>  Considering the Level Set segmentation, a image segmentation algorithm combined the Fast-marchin

11、g with the Narrow-band is developed, extract the organs accurately from the regular medical images. As a foundation of the next 3D reconstruction; Meanwhile, according to the district interested in the character and the

12、environment in which its reasonable selection of seeds, which can solve the bottlenecks of seed selection.</p><p>  According to the regular medical data, use the segmentation method proposed in this paper,

13、a improved Marching Cubes methods based on segmentation and Ray Casting Volume Rending methods based on the color-filled are proposed. The experiments show that it can be better than the traditional method of reconstruct

14、ion.</p><p>  Research the VTK (Visualization Toolkit) and ITK (insight segmentation and registration Toolkit) which widely used at home and abroad, then achieve our segmentation algorithm and the 3D reconst

15、ruction methods with VC + +2005, given the key code.</p><p>  Using the regular medical volume data and the Windows platform, a simple medical visualization system is developed. The system achieved the funct

16、ions of 3D visualization, 2D segmentation, virtual slices human-computer interaction and etc. It has some value of Follow-up research.</p><p>  KEY WORDS: medical visualization, image segmentation, 3D recons

17、truction, VTK, ITK, virtual slice</p><p><b>  ii</b></p><p>  河北工業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文</p><p><b>  目錄</b></p><p><b>  第一章 緒論1</b></p>&l

18、t;p><b>  §1-1 引言1</b></p><p>  §1-2 介紹醫(yī)學(xué)對(duì)象1</p><p>  1-1-1 根據(jù)醫(yī)學(xué)對(duì)象的表現(xiàn)形式分類1</p><p>  1-1-2 主要研究的醫(yī)學(xué)對(duì)象2</p><p>  §1-3 醫(yī)學(xué)圖像分割與體數(shù)據(jù)可視化研究意義2&

19、lt;/p><p>  §1-4 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀與分析3</p><p>  1-4-1 國外針對(duì)可視化3</p><p>  1-4-2 國內(nèi)針對(duì)可視化3</p><p>  §1-5 本論文主要工作及創(chuàng)新4</p><p>  第二章 醫(yī)學(xué)圖像分割方法概述6</p><

20、p>  §2-1 圖像分割的意義6</p><p>  §2-2 目前常用的醫(yī)學(xué)圖像分割方法概述6</p><p>  2-2-1 基于區(qū)域的圖像分割6</p><p>  2-2-2 基于邊緣的圖像分割7</p><p>  2-2-3 基于模型的圖像分割8</p><p>  2

21、-2-4 基于數(shù)學(xué)形態(tài)的圖像分割8</p><p>  2-2-5 基于模糊技術(shù)的圖像分割8</p><p>  2-2-6 基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的圖像分割8</p><p>  2-2-7 基于知識(shí)的圖像分割8</p><p>  §2-3 目前醫(yī)學(xué)圖像分割算法中存在的問題9</p><p>  第三章

22、規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的醫(yī)學(xué)圖像分割算法研究10</p><p>  §3-1 引言10</p><p>  §3-2 水平集方法10</p><p>  3-2-1 水平集理論10</p><p>  3-2-2 窄帶法(Narrow Band Method)12</p><p>  3-2-3 快

23、速行進(jìn)法(Fast Marching Method)13</p><p>  §3-3 分割與配準(zhǔn)開發(fā)工具包(ITK)14</p><p>  §3-4 基于 ITK 的一種改進(jìn)的分割方法14</p><p>  3-4-1 水平集的快速行進(jìn)法和窄帶法相結(jié)合的方法15</p><p>  3-4-2 算法實(shí)現(xiàn)與實(shí)驗(yàn)

24、結(jié)果17</p><p>  §3-5 合理選取種子分割肺部腫瘤18</p><p>  3-5-1 根據(jù)腫瘤特征18</p><p>  3-5-2 根據(jù)腫瘤所處的環(huán)境19</p><p>  3-5-3 結(jié)論20</p><p>  第四章 規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化21</p&g

25、t;<p><b>  iii</b></p><p>  規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化研究</p><p><b>  iv</b></p><p>  河北工業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文</p><p><b>  第一章 緒論</b></p><

26、;p><b>  §1-1 引言</b></p><p>  從 1895 年 x 射線問世以來,傳統(tǒng)的醫(yī)學(xué)診斷方式發(fā)生了根本的變化。計(jì)算機(jī)斷層成像(Computed Tomography, CT)、核磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging, MRI)、超聲(Ultrasonography ,US)、正電子發(fā)射斷層成像(Positron Emissi

27、on Tomography,PET)、單光子發(fā)射斷層成像(Single Photon Emission</p><p>  Computer Tomography,SPECT)及其它模式的醫(yī)學(xué)影像,給醫(yī)學(xué)界帶來了新的革命。而 21 世紀(jì)的我們正是要把這些技術(shù)應(yīng)用于臨床實(shí)踐。但是,這些醫(yī)療設(shè)備只能提供人體內(nèi)部的二維斷層圖像序列或三維數(shù)據(jù),在大多數(shù)情況下,醫(yī)生只能憑經(jīng)驗(yàn)由多幅二維圖像去估計(jì)病灶的大小和形狀,“構(gòu)思”病

28、灶與其周圍組織的空間幾何關(guān)系,這是治療診斷中存在的重大困難之一。現(xiàn)階段,在計(jì)算機(jī)輔助下,從醫(yī)學(xué)圖像中分割出醫(yī)生感興趣區(qū)域(regions of interest, ROI),并結(jié)合可視化技術(shù)進(jìn)行三維顯示,使醫(yī)生對(duì)人體病變部位的觀察更直接、更清晰,有助于進(jìn)一步提高疾病的確診率和治愈率。為此國內(nèi)外很多學(xué)者和研究機(jī)構(gòu)都在對(duì)規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)的可視化做著自己的貢獻(xiàn)。</p><p>  圖像分割是醫(yī)學(xué)圖像處理分析

29、中的一個(gè)重要步驟。由于醫(yī)學(xué)圖像具有極其繁雜的多樣性和復(fù)雜性,并且圖像中還存在噪聲的干擾,這使醫(yī)學(xué)圖像的準(zhǔn)確分割往往具有較大的難度。目前,研究者們提出了許多分割方法,但在臨床應(yīng)用中,這些方法在準(zhǔn)確度、執(zhí)行速度、魯棒性及自動(dòng)化程度上還存在一定問題,因此,設(shè)計(jì)實(shí)用高效的自動(dòng)分割方法一直是研究者們追求的目標(biāo)。</p><p>  醫(yī)學(xué)圖像可視化是醫(yī)學(xué)圖像處理的重要研究內(nèi)容,也是科學(xué)計(jì)算可視化中最成功的應(yīng)用領(lǐng)域之一,已成為

30、輔助疾病診斷和治療的重要手段,并且已深入到醫(yī)學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域。目前已有很多可視化方法,如體繪制、面繪制、局部顯示等等,如何充分利用這些可視化技術(shù)方便、快捷地顯示圖像中有價(jià)值信息已成為目前醫(yī)學(xué)圖像可視化領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。</p><p>  §1-2 介紹醫(yī)學(xué)對(duì)象</p><p>  1-1-1 根據(jù)醫(yī)學(xué)對(duì)象的表現(xiàn)形式分類</p><p>  臨床上根據(jù)需要,通常

31、采用不同的方式對(duì)醫(yī)學(xué)對(duì)象數(shù)據(jù)進(jìn)行組織,根據(jù)其表現(xiàn)形式可以對(duì)醫(yī)學(xué)對(duì)象進(jìn)行如下分類:</p><p>  二維醫(yī)學(xué)對(duì)象:醫(yī)學(xué)對(duì)象的原始數(shù)據(jù)組織形式通常都是以二維圖像序列的形式給出,因此這些原始的醫(yī)學(xué)對(duì)象可以歸類于二維醫(yī)學(xué)對(duì)象。</p><p>  體數(shù)據(jù)醫(yī)學(xué)對(duì)象:通過將上面的二維醫(yī)學(xué)對(duì)象序列組合在一起,描述人體的三維信息,這樣醫(yī)學(xué)對(duì)象的數(shù)據(jù)以體數(shù)據(jù)的形式給出,以這種形式描述的醫(yī)學(xué)對(duì)象就歸屬于體

32、數(shù)據(jù)醫(yī)學(xué)對(duì)象。</p><p>  面數(shù)據(jù)醫(yī)學(xué)對(duì)象:由于體數(shù)據(jù)醫(yī)學(xué)對(duì)象具有較大的數(shù)據(jù)量,進(jìn)行可視化處理比較復(fù)雜且計(jì)算量大,因此在早期以及一些特定的情況下,通常采用從體數(shù)據(jù)醫(yī)學(xué)對(duì)象中抽取出特征輪廓面后再進(jìn)行可視化處理。這種醫(yī)學(xué)對(duì)象是以面數(shù)據(jù)的形式組織其對(duì)象數(shù)據(jù),描述了人體的三維信息,因此可以將其歸類為面數(shù)據(jù)醫(yī)學(xué)對(duì)象。</p><p>  混合數(shù)據(jù)醫(yī)學(xué)對(duì)象:由于一些特殊的目的需要利用體數(shù)據(jù)和面

33、數(shù)據(jù)的優(yōu)點(diǎn),這就需要將體數(shù)據(jù)和面數(shù)據(jù)綜合在一起。這種醫(yī)學(xué)對(duì)象的數(shù)據(jù)是以包含了體數(shù)據(jù)和面數(shù)據(jù)在內(nèi)的混合數(shù)據(jù)的形式進(jìn)行組織的,因此可以將其歸類于混合數(shù)據(jù)醫(yī)學(xué)對(duì)象。</p><p><b>  1</b></p><p>  規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化研究</p><p>  1-1-2 主要研究的醫(yī)學(xué)對(duì)象</p><p&g

34、t;  隨著醫(yī)學(xué)檢查、診斷、治療技術(shù)尤其是醫(yī)學(xué)成像技術(shù)的迅猛發(fā)展,醫(yī)學(xué)對(duì)象變得極為豐富,本文對(duì)紛繁復(fù)雜的醫(yī)學(xué)對(duì)象進(jìn)行了分類研究,從而選擇了規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的醫(yī)學(xué)面數(shù)據(jù),即經(jīng)過預(yù)處理的斷層二維醫(yī)學(xué)圖像進(jìn)行感興趣區(qū)分割提取;選擇規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)進(jìn)行重建及可視化。</p><p>  醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)主要來源于計(jì)算機(jī)斷層圖像(CT)、核磁共振成像(MRI)、核磁共振血管造影(MRA)等成像設(shè)備得到的人體及其內(nèi)部器官的斷層

35、二維圖像序列,通過將上面的二維序列組合在一起,描述人體的三維信息,這樣醫(yī)學(xué)對(duì)象的數(shù)據(jù)就以體數(shù)據(jù)的形式給出。以這種形式描述的醫(yī)學(xué)對(duì)象就屬于三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)[1]。</p><p>  體數(shù)據(jù)(Volume Data)是在有限空間中對(duì)一種或者多種物理屬性的一組離散采樣,可以表示為:</p><p>  f( x), x Rn , {x}是 n 維空間采樣點(diǎn)(Sample Point)的集合,因此

36、也將體數(shù)據(jù)稱為數(shù)據(jù)集(Dataset)。體素(Voxel)是組成體數(shù)據(jù)的最基本單位。通常有兩種體素定義,一種是把體素定義為中心點(diǎn)在采樣點(diǎn)上的小長方體,這個(gè)小長方體內(nèi)的值是不變的,都等于該采樣點(diǎn)的采樣值。另一種是以八個(gè)相鄰的網(wǎng)絡(luò)</p><p>  ((i, j, k),(i 1, j, k),(i, j 1, k),(i, j, k 1),(i 1, j 1, k),(i 1, j, k 1),(i, j 1,

37、k 1),(i 1, j 1, k 1))</p><p>  為頂點(diǎn)的小長方體當(dāng)作一個(gè)體素,這個(gè)小長方體內(nèi)的值是變化的,體素內(nèi)任一點(diǎn)的值可以用八個(gè)頂點(diǎn)上采樣值的三線性差值計(jì)算出來。因此,三維體數(shù)據(jù)可以看成是由許許多多個(gè)體素組成的。當(dāng)固定某一維 ,就得到一幅二維圖像,稱之為斷層圖像(Sectional Image)或切片(Slice)[2]。斷層圖像經(jīng)配準(zhǔn)后就可得到規(guī)則的數(shù)據(jù)場(chǎng)。頂點(diǎn) ( Xi, Yi, Zi)

38、分布在規(guī)則的、網(wǎng)絡(luò)的網(wǎng)格點(diǎn)上,函數(shù)值為 F ( Xi, Yi, Zi) ,這樣的數(shù)據(jù)集稱為規(guī)則三維體數(shù)據(jù)。</p><p>  規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化就是運(yùn)用計(jì)算機(jī)圖形學(xué)和圖像處理技術(shù),對(duì)經(jīng)過預(yù)處理的斷層二維醫(yī)學(xué)圖像進(jìn)行感興趣區(qū)分割提??;并選擇規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)進(jìn)行重建,然后通過人機(jī)交互進(jìn)行顏色和多種屬性的顯示??梢暬筢t(yī)生可以在屏幕上形象逼真地顯示人體組織內(nèi)部的復(fù)雜結(jié)構(gòu),從而幫助醫(yī)生做出準(zhǔn)確的診斷

39、和制定正確的手術(shù)方案。</p><p>  §1-3 醫(yī)學(xué)圖像分割與體數(shù)據(jù)可視化研究意義</p><p>  近四十多年來,隨著計(jì)算機(jī)斷層成像(CT)、核磁共振成像(MRI)、超聲(US)等新醫(yī)學(xué)成像技術(shù)在輔助醫(yī)療診斷、術(shù)前計(jì)劃、手術(shù)導(dǎo)航、術(shù)后監(jiān)測(cè)、遠(yuǎn)程醫(yī)療等環(huán)節(jié)的廣泛應(yīng)用,醫(yī)學(xué)影像處理與分析已成為目前醫(yī)學(xué)技術(shù)中發(fā)展最快、成果最顯著的領(lǐng)域之一。利用計(jì)算機(jī)和數(shù)字圖像處理技術(shù)對(duì)醫(yī)學(xué)圖

40、像進(jìn)行處理,獲取圖像中有價(jià)值信息,輔助疾病診斷,進(jìn)一步提高診斷的準(zhǔn)確率,已受到世界許多國家的高度重視。</p><p>  在醫(yī)療診斷中,觀察病人的一組二維斷層圖像是醫(yī)生診斷病情的常規(guī)方式。但是,要準(zhǔn)確地確定腫瘤的空間位置、大小、幾何形狀以及與周圍生物組織之間的空間關(guān)系,僅憑醫(yī)生“在頭腦中進(jìn)行判定”是十分困難的,因此迫切需要一種行之有效的工具來完成對(duì)人體器官、軟組織和腫瘤的三維重建和三維顯示??梢暬夹g(shù)就是輔助醫(yī)

41、生對(duì)病變體和周圍組織進(jìn)行分析和顯示的有效的工具,它極大地提高了醫(yī)療診斷的準(zhǔn)確性和科學(xué)性。醫(yī)學(xué)圖像的三維可視化為現(xiàn)代醫(yī)學(xué)發(fā)展提供了基礎(chǔ),除了用于輔助醫(yī)療診斷外,也是外科手術(shù)、醫(yī)學(xué)教學(xué)、遠(yuǎn)程手術(shù)等醫(yī)學(xué)課題的基本環(huán)節(jié)。基于規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)三維可視化是其重要分支之一。</p><p>  醫(yī)學(xué)圖像分割技術(shù)是醫(yī)學(xué)圖像處理與分析中的關(guān)鍵技術(shù),是從醫(yī)學(xué)圖像中提取特殊組織信息的一個(gè)必不可少步驟。醫(yī)學(xué)圖像分割按其處理方式不同

42、可分為二維分割和三維分割兩種方式,由于三維分割方法可充分考慮切片數(shù)據(jù)在灰度和空間位置上的相關(guān)性,往往具有較高的分割準(zhǔn)確率,是近幾年來的研究熱點(diǎn)。由于人體組織結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性以及噪音,成像設(shè)備獲取的圖像不可避免具有模糊、不均勻等特性。此外,人與人之間的解剖組織結(jié)構(gòu)還存在相當(dāng)大的差別,這些都給醫(yī)學(xué)圖像的分割帶來了困難,使醫(yī)學(xué)圖像分割成為目前圖像處理與分析領(lǐng)域的一個(gè)極具挑戰(zhàn)性的課題。</p><p>  可視化技術(shù)是目前的

43、一個(gè)研究熱點(diǎn),運(yùn)用三維可視化技術(shù)對(duì)分割結(jié)果進(jìn)行三維重建,以三維形式展示分割結(jié)果,使醫(yī)生可以從多角度、多層次觀察和分析病灶區(qū)域,在很大程度上彌補(bǔ)了影像設(shè)備在成像</p><p><b>  2</b></p><p>  河北工業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文</p><p>  上的不足,從而為臨床診斷、病理分析以及病理學(xué)研究提供了可靠的依據(jù)。</p&

44、gt;<p>  三維醫(yī)學(xué)圖像分割與可視化已成為目前醫(yī)學(xué)圖像處理領(lǐng)域的研究熱點(diǎn),并具有廣泛的應(yīng)用前景和現(xiàn)實(shí)意義,主要表現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:</p><p>  用于測(cè)量人體器官、組織或病灶的體積。通過對(duì)這些體積在治療前后的定量測(cè)量和分析,可以幫助醫(yī)生進(jìn)行診斷,制定或修改病人治療方案。</p><p>  通過三維重建和可視化,有助于選擇最佳手術(shù)路徑、減少手術(shù)損傷和對(duì)臨近組織的損

45、害,提高病變體定位精度,完成復(fù)雜外科手術(shù)和提高手術(shù)成功率。</p><p>  圖像的分割結(jié)果常用于醫(yī)學(xué)圖像的分析,如不同圖像融合、解剖的測(cè)量、獲取先驗(yàn)知識(shí)用于圖像重建及運(yùn)動(dòng)的跟蹤等。</p><p>  有助于用來在病人治療期間觀察藥物、放射或其它療法所引起的身體病變部位的局部變化,有助于對(duì)療效的估計(jì)。</p><p>  分割后圖像與噪聲的關(guān)系減弱,因此具有降噪

46、功能,便于圖像理解。</p><p>  為醫(yī)學(xué)培訓(xùn)、醫(yī)學(xué)研究和教學(xué)提供數(shù)字實(shí)現(xiàn)手段。</p><p>  圖像分割結(jié)果可用于在不丟失有用信息的前提下進(jìn)行數(shù)據(jù)的壓縮和傳輸。這對(duì)于提高在</p><p>  PACS( Picture Archiving and Communications System)、遠(yuǎn)程醫(yī)療和 Internet 中圖像傳輸速度是至關(guān)重要的。&

47、lt;/p><p>  §1-4 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀與分析</p><p>  1-4-1 國外針對(duì)可視化</p><p>  科學(xué)計(jì)算可視化(Visualization in Scientific Computing)是發(fā)達(dá)國家 20 世紀(jì) 80 年代后期提出并發(fā)展起來的一個(gè)新的研究領(lǐng)域??茖W(xué)計(jì)算可視化這一學(xué)科的誕生通常以 1987 年 2 月美國國家科學(xué)基金會(huì)

48、召開的關(guān)于圖像處理和工作站的圖形學(xué)研討會(huì)上發(fā)表的總報(bào)告為標(biāo)志[3],隨后美國、西歐、日本紛紛進(jìn)行科學(xué)計(jì)算可視化理論和方法的研究。自 1990 年以來,美國電氣和電子工程師學(xué)會(huì)(IEEE)每年舉行一次有關(guān)科學(xué)計(jì)算可視化的學(xué)術(shù)會(huì)議,出版論文集。 1995 年開始,美國 IEEE 匯刊中又增加了一種刊物 “Transactions on Visualization and Computer Graphics”,同時(shí)大批可視化軟件系統(tǒng)形成商品推

49、向市場(chǎng)。如美國 Stardent 計(jì)算機(jī)公司推出的 AVS 系統(tǒng),美國俄亥俄超級(jí)計(jì)算機(jī)中心開發(fā)的 apE 系統(tǒng),德國達(dá)姆斯達(dá)特 FHG-AGD 研究中心開發(fā)的 VIS-A-VIS 系統(tǒng)等[4]。目前在醫(yī)學(xué)影像研究領(lǐng)域使用最廣泛的兩個(gè)算法平臺(tái)是 VTK(Visualization Toolkit)和 ITK(Insight</p><p>  VTK 開發(fā)了一個(gè)醫(yī)學(xué)影像可視化系統(tǒng) VolView 這個(gè)商業(yè)軟件。此外

50、已經(jīng)有了可以顯示三維醫(yī)學(xué)圖像的商品化系統(tǒng)。例如,加拿大的 Allegro 系統(tǒng),它可與不同廠家的 CT 和 MRI 儀相聯(lián)接、以色列愛爾新特公司(ElscintLtd)、美國通用電器公司(GE)出產(chǎn)的螺旋 CT 掃描設(shè)備均附有基于圖像工作站的醫(yī)學(xué)圖像可視化系統(tǒng)。</p><p>  1-4-2 國內(nèi)針對(duì)可視化</p><p>  1995 年,國家醫(yī)療衛(wèi)生信息產(chǎn)業(yè)工程納入國家“金”字系列工

51、程,隨著“金衛(wèi)”工程的進(jìn)展,國內(nèi)也越來越重視計(jì)算機(jī)及圖像處理技術(shù)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用,一些研究機(jī)構(gòu)、醫(yī)療單位和商業(yè)公司都在進(jìn)行該領(lǐng)域的研發(fā)工作。在醫(yī)學(xué)圖像三維重建及可視化研究方面,浙江大學(xué)、清華大學(xué)、東南大學(xué)、中科</p><p>  院自動(dòng)化所等均做了大量研究,開發(fā)了一些實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)。其中,中科院自動(dòng)化所在研發(fā) MITK 軟件包基礎(chǔ)之上,用六年時(shí)間開發(fā)了三維醫(yī)學(xué)圖像處理與分析系統(tǒng) 3DMed,它是一套功能完備的影像醫(yī)學(xué)

52、系統(tǒng),可使研究人員自由獲取 CT,MR 等設(shè)備產(chǎn)生的數(shù)據(jù),利用本系統(tǒng)進(jìn)行數(shù)據(jù)的多角度、多方面的三維重建和可視化,充分利用影像設(shè)備獲取的臨床數(shù)據(jù)為臨床醫(yī)學(xué)積累更多的素材。它的推廣應(yīng)用將極大推動(dòng)影像醫(yī)學(xué)在我國的發(fā)展,促進(jìn)我國數(shù)字醫(yī)療水平的提高與發(fā)展。浙江工業(yè)大學(xué)也通過綜合 VTK 和實(shí)時(shí)體</p><p>  繪制硬件系統(tǒng) VolumePro,采用軟硬結(jié)合的方式解決醫(yī)學(xué)對(duì)象可視化在微機(jī)中繪制和交互實(shí)時(shí)性問題的方案,實(shí)

53、現(xiàn)了醫(yī)學(xué)對(duì)象實(shí)時(shí)可視化系統(tǒng)及技術(shù)平臺(tái) 4DView ,具有很好的可擴(kuò)展性和開放型[5]。</p><p><b>  3</b></p><p>  規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化研究</p><p>  圖像分割技術(shù)一直是圖像處理領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。目前圖像分割方法很多,但由于人體解剖結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性、組織器官形狀的不規(guī)則性、個(gè)體之間的差異性以及不

54、同醫(yī)學(xué)成像模式成像特征的不同,一般的圖像分割方法對(duì)醫(yī)學(xué)圖像的處理效果并不理想。醫(yī)學(xué)圖像分割通常具有針對(duì)性,沒有哪一種分割方法對(duì)所有的圖像模式都適用[6]。醫(yī)學(xué)圖像分割經(jīng)歷了一個(gè)從人工分割到半自動(dòng)分割最后到自動(dòng)分割的發(fā)展過程。早期的人工分割是讓專家從醫(yī)學(xué)圖像中手工描繪出不同結(jié)構(gòu)的邊界,然后提取出所要解剖結(jié)構(gòu)的區(qū)域信息,這是一個(gè)工作量非常大,甚至令人厭煩的過程。隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)和圖像處理技術(shù)的發(fā)展,半自動(dòng)化分割方法[7,8,9]漸漸取代了人工

55、操作,通過一定的人機(jī)交互,由計(jì)算機(jī)完成分割,大大減少了人為因素的干擾,并且具有較快的分割速度和較高的分割精度,但操作者的經(jīng)驗(yàn)和知識(shí)仍然是圖像分割過程中的一個(gè)重要的制約因素。近年來,由于大量新興技術(shù)如模糊技術(shù)、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和人工智能技術(shù)在圖像分割中的應(yīng)用,醫(yī)學(xué)圖像分割領(lǐng)域也涌現(xiàn)出一些自動(dòng)分割技術(shù)[10,11],但大部分方法復(fù)雜度較高,運(yùn)算量較大,目前仍處在試驗(yàn)階段,真正在臨床中得到應(yīng)用的不多。</p><p>  目前

56、,醫(yī)學(xué)圖像分割方法的研究主要有以下 4 個(gè)趨勢(shì):</p><p>  提高算法的自動(dòng)化程度[12,13,14],排除或盡可能減少人工干預(yù)。</p><p>  降低算法的復(fù)雜性,提高其執(zhí)行速度[15,16,17]。數(shù)字醫(yī)學(xué)圖像的數(shù)據(jù)量一般很大,算法越復(fù)雜,提取的特征越多,計(jì)算量越大,對(duì)計(jì)算機(jī)的存儲(chǔ)量、計(jì)算精度、計(jì)算速度等性能的要求越高,必然導(dǎo)致其在實(shí)際應(yīng)用中受到一定的限制。</p&g

57、t;<p>  提高算法的分割精度[18,19]。這是醫(yī)學(xué)圖像分割領(lǐng)域一直關(guān)注的一大難題,分割結(jié)果的好壞會(huì)影響醫(yī)生對(duì)疾病的診斷,不正確的分割結(jié)果甚至?xí)?dǎo)致醫(yī)生對(duì)疾病做出錯(cuò)誤的判斷。因此,在現(xiàn)有的基礎(chǔ)上進(jìn)一步提高算法的分割精度是目前許多研究者一直致力解決的問題。</p><p>  提高算法的魯棒性[20,21]。魯棒性是醫(yī)學(xué)圖像分割中還沒有得到很好解決的問題。由于深受個(gè)體不定因素,如圖像模式、特征參

58、數(shù)、計(jì)算方法、閾值設(shè)置、分析步驟、初始化處理、人為因素等影響,要在圖像分割中獲得非常好的魯棒性是非常困難的。因此,如何提高圖像分割算法的魯棒性就成為醫(yī)學(xué)圖像分割中急需解決的一個(gè)難題。</p><p>  醫(yī)學(xué)圖像可視化方法可分為兩大類:二維切片可視化和三維體數(shù)據(jù)可視化。二維切片可視化是對(duì)切片圖像進(jìn)行處理,顯示醫(yī)生想獲取的重要信息,如灰度加窗操作、強(qiáng)度分層 [22]等等,其技術(shù)已比較成熟。醫(yī)學(xué)圖像的三維可視化是利用

59、一系列的二維切片圖像重建三維圖像模型,主要有兩種技術(shù):面繪制和體繪制,由于三維可視化可提供具有真實(shí)感的三維醫(yī)學(xué)圖像,使醫(yī)生可以從多角度、多層次分析病變區(qū)域,受到了廣泛的重視。目前,醫(yī)學(xué)圖像可視化技術(shù)的研究主要有以下 3 個(gè)趨勢(shì):</p><p>  提高圖像可視化質(zhì)量,如提高等值面的光滑程度、改進(jìn)插值算法等等。</p><p>  加快可視化速度。醫(yī)學(xué)圖像數(shù)據(jù)量大,直接體繪制的計(jì)算量大,耗

60、費(fèi)時(shí)間長,因此快速體可視化是目前的一個(gè)重要研究方向[23]。</p><p>  三維圖像內(nèi)部信息的可視化研究,如開窗操作,切片提取等等[24]。</p><p>  §1-5 本論文主要工作及創(chuàng)新</p><p>  本論文針對(duì)醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù),從科學(xué)可視化的角度出發(fā),重點(diǎn)研究了水平集的分割算法和基于分割的三維重建方法。論文所做的主要工作及創(chuàng)新成果包括:<

61、;/p><p>  討論了規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)、醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化分割和三維重建技術(shù)的相關(guān)概念,分析了當(dāng)前國內(nèi)外的發(fā)展情況。</p><p>  對(duì)水平集分割進(jìn)行研究,提出了水平集的快速行進(jìn)法和窄帶法相結(jié)合的圖像分割算法,從規(guī)則的醫(yī)學(xué)圖像中準(zhǔn)確地提取出目標(biāo)組織器官,為接下來的三維重建做基礎(chǔ);與此同時(shí),根據(jù)感興趣區(qū)的特性和其所處的環(huán)境合理選取種子點(diǎn),解決分割中對(duì)種子選取的瓶頸問題。</p>&

62、lt;p>  根據(jù)規(guī)則的醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù),利用本文提出的分割方法,研究了基于分割的改進(jìn)的 Marching Cubes 方法和基于顏色填充的光線投影體繪制方法,用實(shí)驗(yàn)表明,比傳統(tǒng)的重建方法具有較高的可視化效果。</p><p>  研究了國內(nèi)外正在普遍使用的 VTK(Visualization Toolkit) 和 ITK(insight segmentation and</p><p>

63、<b>  4</b></p><p>  河北工業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文</p><p>  registration Toolkit)開發(fā)工具包,并用 VC++2005 實(shí)現(xiàn)了我們提出的分割算法和三維重建方法,給出關(guān)鍵代碼。</p><p>  用規(guī)則醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù),在 Windows 平臺(tái)上,結(jié)合 ITK、VTK 研究出一套簡單的醫(yī)學(xué)可視化系統(tǒng),該

64、系統(tǒng)采用面繪制和體繪制的方法,并基于 ITK 的感興趣區(qū)提取技術(shù),實(shí)現(xiàn)了三維顯示、二維分割、虛擬切片顯示、人機(jī)交互等功能,具有一定的后續(xù)研發(fā)參考價(jià)值。</p><p>  全文共分為六章。第一章主要介紹了醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)格式及圖像分割和可視化的研究意義、國內(nèi)外研究現(xiàn)狀。第二章分析了目前醫(yī)學(xué)圖像分割的主要方法,并對(duì)各類方法的優(yōu)缺點(diǎn)進(jìn)行了比較。第三章根據(jù)現(xiàn)</p><p>  有分割方法的優(yōu)缺點(diǎn),提

65、出了一種更有效的分割方法并利用 ITK(insight segmentation and registration Toolkit)開發(fā)工具包實(shí)現(xiàn),同時(shí)還根據(jù)圖像特征討論了種子點(diǎn)的選取方法。第四章首先回顧了目前的三維可視化方法,介紹了可視化組件庫 VTK(Visualization Toolkit),然后用本文提出的分割方法,研究了基于分割的改進(jìn)的 Marching Cubes 方法和基于顏色填充的光線投影體繪制方法,用實(shí)驗(yàn)表明,比傳統(tǒng)

66、的重建方法具有較高的可視化效果。第五章結(jié)合 ITK、VTK,設(shè)計(jì)了一套三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化系統(tǒng)。最后一章為工作總結(jié)和展望。</p><p><b>  5</b></p><p>  規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化研究</p><p>  第二章 醫(yī)學(xué)圖像分割方法概述</p><p>  §2-1 圖像分割的

67、意義</p><p>  在對(duì)圖像處理的研究和應(yīng)用中,人們往往僅對(duì)圖像中的某些部分感興趣,這些感興趣的部分稱為目標(biāo)或?qū)ο?,它們一般?duì)應(yīng)圖像中特定的、具有獨(dú)特性質(zhì)的區(qū)域。圖像處理的重要任務(wù)就是對(duì)圖像中的對(duì)象進(jìn)行分析和理解。為了辨識(shí)和分析目標(biāo),需要將這些區(qū)域分割提取出來,在此基礎(chǔ)上才有可能對(duì)目標(biāo)進(jìn)一步利用,如進(jìn)行特征提取和測(cè)量。圖像分割的目的是把物體從圖像中分離出來,同時(shí)得到相應(yīng)的提取圖像。圖像分割是由圖像處理到圖像

68、分析的關(guān)鍵步驟,一方面,它是表達(dá)目標(biāo)的基礎(chǔ),對(duì)特征測(cè)量有重要的影響;另一方面,圖像分割及基于分割的目標(biāo)表達(dá)、特征提取和參數(shù)測(cè)量等,都將原圖像轉(zhuǎn)化為更抽象、更緊湊的形式,從而使更高層的圖像分析和理解成為可能。</p><p>  我們可以借助集合的概念來定義圖像分割[25]:</p><p>  令集合 R代表整個(gè)圖像區(qū)域,對(duì) R的分割可看作將 R分成 N 個(gè)滿足以下五個(gè)條件的非空子集(子區(qū)

69、域) R1, R2 , , RN :</p><p><b>  N</b></p><p><b>  Ri R</b></p><p><b>  i 1</b></p><p>  對(duì)所有的 i和 j, i j,有 Ri Rj</p><

70、p>  對(duì) i 1,2, , N,有 P( Ri) TRUE</p><p>  對(duì) i j,有 P( Ri Rj ) FALSE</p><p>  對(duì) i 1,2, , N, Ri 是連通的區(qū)域</p><p>  其中 P( Ri) 是對(duì)所有在集合 Ri 中元素的邏輯謂詞, 代表空集。條件 1 指出一幅圖像的分割結(jié)果中全部區(qū)域的總合(并集

71、)應(yīng)能包括圖像中所有像素(即原圖像);條件 2 指出分割結(jié)果中各個(gè)區(qū)域是相互不重疊的,或者說在分割結(jié)果中一個(gè)像素不能同時(shí)屬于兩個(gè)區(qū)域;條件 3 指出屬于同一個(gè)區(qū)域中的像素應(yīng)該具有某些相同特性;條件 4 指出分割結(jié)果中屬于不同區(qū)域的像素應(yīng)該具有一些不同的特性;條件 5 要求分割結(jié)果中同一個(gè)區(qū)域內(nèi)的任意兩個(gè)像素在該區(qū)域內(nèi)互相連通,或者說分割得到的區(qū)域是一個(gè)連通成分。</p><p>  圖像分割的應(yīng)用非常廣泛,例如:

72、在遙感應(yīng)用中,合成孔徑雷達(dá)圖像中目標(biāo)的分割;醫(yī)學(xué)應(yīng)用中,腦部圖像分割成灰質(zhì)、白質(zhì)、腦脊髓等腦組織區(qū)域和對(duì)腫瘤的靶向定位;在交通圖像分析中,把車輛目標(biāo)從背景中分割出來等。在這些應(yīng)用中,分割通常是為了進(jìn)一步對(duì)圖像進(jìn)行分析、識(shí)別、壓縮編碼等,分割的準(zhǔn)確性直接影響后續(xù)任務(wù)的有效性,因此,圖像分割的研究具有非常重要的意義。</p><p>  §2-2 目前常用的醫(yī)學(xué)圖像分割方法概述</p><

73、;p>  目前常用的圖像分割方法有多種,這些方法大致可分為七類:基于區(qū)域的圖像分割,基于邊緣的圖像分割,基于模型的圖像分割,基于數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)的圖像分割,基于模糊理論的圖像分割,基于人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的圖像分割,基于知識(shí)的圖像分割。</p><p>  2-2-1 基于區(qū)域的圖像分割</p><p>  基于區(qū)域的方法是圖像分割中最常用的方法,它以區(qū)域?yàn)樘幚韺?duì)象,按照?qǐng)D像特征屬性劃分為不同圖像

74、區(qū)域,主要方法有閾值法、區(qū)域生長法、區(qū)域分裂和合并法、聚類法等。</p><p><b>  1. 閾值法</b></p><p><b>  6</b></p><p>  河北工業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文</p><p>  閾值法是最常見的并行檢測(cè)區(qū)域分割方法[25]。對(duì)灰度圖像的閾值分割就是先確定一

75、個(gè)處于圖像灰度取值范圍之中的灰度閾值,然后將圖像中各個(gè)像素的灰度值都與這個(gè)閾值相比較,并根據(jù)比較結(jié)果將對(duì)應(yīng)的像素分為兩類。這兩個(gè)像素一般分屬圖像的兩類區(qū)域,從而達(dá)到分割的目的。確定一個(gè)最優(yōu)閾值是閾值分割的關(guān)鍵,現(xiàn)有的大部分算法都是集中在閾值確定的研究上。閾值分割方法一般可以分為全局閾值法和局部閾值法。全局閾值法指利用全局信息(例如整幅圖像的灰度直方圖)對(duì)整幅圖像求出最優(yōu)分割閾值,可以是單閾值,也可以是多閾值;局部閾值法是把原始的整幅圖像

76、分為若干個(gè)小的子圖像,在對(duì)每個(gè)子圖像應(yīng)用全局閾值法分別求出最優(yōu)分割閾值。閾值分割的優(yōu)點(diǎn)是實(shí)現(xiàn)簡單,當(dāng)圖像中不同對(duì)象的灰度值或其它特征值差別很大時(shí),它能夠有效地進(jìn)行分割(如用于硬件實(shí)現(xiàn))。但閾值分割也有很大缺點(diǎn),如果圖像中不存在明顯的灰度差異或各對(duì)象的灰度值范圍有較大重疊,則很難取得令人滿意的分割結(jié)果。此外,閾值分割僅僅考慮圖像的灰度信息而沒有考慮圖像的空間信息,對(duì)噪聲和灰度不均勻十分敏感。</p><p><

77、;b>  區(qū)域生長法</b></p><p>  區(qū)域生長法的基本思想是將具有相似性質(zhì)的像素集中起來構(gòu)成區(qū)域。區(qū)域生長是把圖像分割成若干</p><p>  小區(qū)域,比較相鄰小區(qū)域特征的相似性,若它們足夠相似則作為同一區(qū)域合并,以此方式將特征相似的小區(qū)域不斷合并,直到不能合并為止,最后形成特征不同的各個(gè)區(qū)域。</p><p>  該方法首先要選取合

78、適的種子點(diǎn),然后依次將種子周圍的相似像素合并到種子像素所在區(qū)域。制約區(qū)域生長算法性能的因素主要有兩個(gè)方面:一是特征度量和區(qū)域生長規(guī)則的設(shè)計(jì),二是算法復(fù)雜度。區(qū)域增長算法的優(yōu)點(diǎn)是計(jì)算簡單,效率高,對(duì)于較均勻的連通目標(biāo)有較好的分隔效果。缺點(diǎn)是它需要人機(jī)交互設(shè)置種子和閾值,同時(shí)區(qū)域生長算法也對(duì)噪聲敏感,常會(huì)產(chǎn)生“空洞”或生長過度,而且由于它是一種串行算法,當(dāng)目標(biāo)較大時(shí),分隔速度較慢。</p><p><b>

79、  區(qū)域分裂與合并法</b></p><p>  當(dāng)事先完全不了解區(qū)域形狀和區(qū)域數(shù)目時(shí),可采用分裂合并法。區(qū)域分裂與合并法是基于四叉樹的思想,首先對(duì)整幅圖像進(jìn)行分裂,然后依據(jù)某種規(guī)則合并性質(zhì)相似的小區(qū)域,或?qū)⒁粋€(gè)性質(zhì)不一致區(qū)域分裂為更小的區(qū)域,如此遞歸進(jìn)行,直到最后完成分割任務(wù)。分裂合并法可以采用與區(qū)域生長法相類似的一致性準(zhǔn)則,優(yōu)點(diǎn)是對(duì)復(fù)雜圖像的分割效果較好,不需要指定初始點(diǎn)或區(qū)域,并且一次可以分割出

80、所有輪廓。但缺點(diǎn)是算法較復(fù)雜,計(jì)算量大,分裂可能破壞區(qū)域的邊界。</p><p><b>  聚類法</b></p><p>  聚類法是一種無監(jiān)督的圖像分割方法,它把圖像映射到特征空間,然后根據(jù)像素在特征空間中的特</p><p>  性對(duì)像素進(jìn)行分類。常見的聚類法主要有 C-均值法(C-Means)和模糊 C-均值法(Fuzzy C-Mea

81、ns)[26-30]。C-均值法是一種迭代算法,在每一次迭代中,先計(jì)算各類特征向量的平均值,然后按照最小均方差原則對(duì)每個(gè)像素進(jìn)行重新分類。模糊 C-均值法是在 C-均值算法的基礎(chǔ)上引入模糊集理論概念,將硬分類轉(zhuǎn)化為軟分類。聚類分割的優(yōu)點(diǎn)是無監(jiān)督的分割,無需樣本學(xué)習(xí),缺點(diǎn)是缺乏對(duì)像素空間拓?fù)潢P(guān)系的描述 ,并且對(duì)噪聲敏感。</p><p>  2-2-2 基于邊緣的圖像分割</p><p> 

82、 基于邊緣的分割方法是最早提出的圖像分割方法。它是一種基于圖像灰度幅值不連續(xù)性的分割方法,它通過檢測(cè)非同質(zhì)區(qū)域之間的邊界來實(shí)現(xiàn)對(duì)圖像的分割。按照邊緣連接或跟蹤時(shí)采用策略的不同,可以將邊緣檢測(cè)方法分成兩大類:并行邊緣檢測(cè)技術(shù)和串行邊緣檢測(cè)技術(shù)。</p><p>  常見的并行邊緣檢測(cè)技術(shù)有:基于邊緣檢測(cè)算子的方法、邊界法和哈夫變換等。邊緣的檢測(cè)可以借助邊緣檢測(cè)算子與圖像模板求卷積來完成,常見的邊緣檢測(cè)算子有 Rob

83、ert、Sobel 和 Laplace 算子等, Marr 算法[31]是這類方法的經(jīng)典代表。邊界閉合法[25]是由圖像梯度圖中一個(gè)邊緣點(diǎn)出發(fā),以此搜索并連接相鄰邊緣點(diǎn)從而逐步檢測(cè)出邊界的方法。哈夫變換法[25]是利用圖像全局特征將邊緣像素連接起來組成閉合邊界的一種方法。它主要優(yōu)點(diǎn)是受噪聲和曲率間斷的影響較小。</p><p>  串行邊緣檢測(cè)技術(shù)首先要檢測(cè)出一個(gè)邊緣起始點(diǎn),然后根據(jù)某種相似性準(zhǔn)則尋找和前一點(diǎn)同類

84、的邊緣點(diǎn),再將它們串行連接成閉合邊界。但這種方法比較復(fù)雜,計(jì)算量很大。</p><p>  總之,基于邊緣檢測(cè)的分割方法的難點(diǎn)在于邊緣檢測(cè)時(shí)抗噪性和檢測(cè)精度的矛盾,如果提高檢測(cè)精度,則噪聲產(chǎn)生的偽邊緣會(huì)導(dǎo)致不合理的輪廓;如果提高抗噪性,則會(huì)產(chǎn)生輪廓漏檢和位置偏差。</p><p><b>  7</b></p><p>  規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)

85、體數(shù)據(jù)可視化研究</p><p>  2-2-3 基于模型的圖像分割</p><p>  形變模型最初是由 Kass[32]等人在 1987 年提出的,即著名的主動(dòng)輪廓模型,也稱 Snakes。它以一個(gè)能量最小化變化的樣條表示圖像中彈性對(duì)象的輪廓或表面,其形變受到許多不同能量項(xiàng)的約束?;谛巫兡P偷姆椒ňC合利用了區(qū)域與邊界信息,是目前研究最多、應(yīng)用最廣的分割方法之一,它提供了一種高效的圖像

86、分析方法,結(jié)合了幾何學(xué)、物理學(xué)和近似理論。該方法通過使用從圖像數(shù)據(jù)獲得的約束信息(自底向上)和目標(biāo)的位置、大小和形狀等先驗(yàn)知識(shí)(自頂向下),可有效地對(duì)目標(biāo)進(jìn)行分割、匹配和跟蹤分析?;趨?shù)形變模型的分割過程就是使模型在外能和內(nèi)能的作用下向物體邊緣靠近,外力推動(dòng)輪廓曲線(曲面)運(yùn)動(dòng),而內(nèi)力保持輪廓的光滑性。該方法基于某種形式的目標(biāo)函數(shù)的優(yōu)化,目標(biāo)函數(shù)最基本的形式就是在某種基于圖像的能量項(xiàng)和另一個(gè)與內(nèi)部能量或形狀模型相關(guān)項(xiàng)之和。形變模型的主

87、要優(yōu)點(diǎn)是能夠直接產(chǎn)生閉合的曲線或曲面,并對(duì)噪聲和偽邊界有很強(qiáng)的魯棒性;缺點(diǎn)是它對(duì)初始邊界位置十分敏感,有時(shí)需要人工選擇合適的參數(shù)。目前,已經(jīng)出現(xiàn)了許多成熟的圖像分割方法,其中主動(dòng)輪廓模型[33]以及 Mumford-Shah 模型[34]都是較為常用的方法。</p><p>  2-2-4 基于數(shù)學(xué)形態(tài)的圖像分割</p><p>  近年來,數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)在圖像處理中的應(yīng)用日漸受到重視,在邊緣

88、檢測(cè)和圖像分割中得到了廣泛的研究和應(yīng)用。它的基本思想是用具有一定形態(tài)的結(jié)構(gòu)元素去量度和提取圖像中對(duì)應(yīng)形狀以達(dá)到對(duì)圖像分析和識(shí)別的目的。利用膨脹、腐蝕、開啟和閉合四個(gè)基本運(yùn)算進(jìn)行推導(dǎo)和組合,可以產(chǎn)生各種形態(tài)學(xué)實(shí)現(xiàn)算法,如邊界提取、區(qū)域填充、連通分量提取、凸殼、細(xì)化、骨架、裁減等等。形態(tài)學(xué)理論在圖像分割中應(yīng)用比較有代表性的是分水嶺算法[35],它是以對(duì)圖像進(jìn)行三維可視化處理為基礎(chǔ)的,其基本思想來源于地理學(xué):它將原圖像的梯度圖像看作一幅地形圖

89、,而梯度值對(duì)應(yīng)海拔高度,圖像中不同梯度值的區(qū)域就對(duì)應(yīng)于山峰和山谷間的盆地。如果在各個(gè)局部最小點(diǎn)的位置上打一個(gè)洞,讓水以均勻速率從洞中溢出,從底到高淹沒整個(gè)地形。當(dāng)處在不同的匯聚盆地中的水將要聚合在一起時(shí),修建大壩將其阻止,因此通過該算法可以提取出連續(xù)的邊界線。</p><p>  2-2-5 基于模糊技術(shù)的圖像分割</p><p>  基于模糊技術(shù)的圖像分割方法是以模糊數(shù)學(xué)位基礎(chǔ),醫(yī)學(xué)圖像

90、本質(zhì)上是模糊的,在醫(yī)學(xué)圖像中存在許多不確定的因素,如灰度、紋理和區(qū)域的邊界等,這些不確定性給圖像分割帶來了許多麻煩,但是卻給模糊技術(shù)提供了用武之地。近年來,隨著模糊技術(shù)的不斷成熟,在圖像分割中的應(yīng)用日益活躍,成為醫(yī)學(xué)圖像分割技術(shù)的一個(gè)研究熱點(diǎn),許多模糊分割技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生,如應(yīng)用模糊子集理論的模糊分割技術(shù) ,模糊 C-均值聚類分割技術(shù),應(yīng)用模糊邏輯的基于 IF-THEN 規(guī)則的模糊分割技術(shù)。此外,模糊技術(shù)可以與其他技術(shù)很好地融合,諸如模糊閾

91、值,模糊聚類,模糊邊緣檢測(cè)等等。目前應(yīng)用模糊技術(shù)的難點(diǎn)問題是如何選取最優(yōu)隸屬函數(shù)和確定最佳隸屬度。</p><p>  2-2-6 基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的圖像分割</p><p>  人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Artificial neural networks, ANN)是近年來發(fā)展起來的大規(guī)模并行處理系統(tǒng)。ANN 具有模擬人類信號(hào)處理的功能,因此非常擅長于解決模式識(shí)別領(lǐng)域中的模式分類問題。基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的分

92、割方法的基本思想是用訓(xùn)練樣本集對(duì)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練以確定節(jié)點(diǎn)間的連接和權(quán)值,再用訓(xùn)練好的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分割新的圖像數(shù)據(jù),但這種方法需要大量的訓(xùn)練數(shù)據(jù)。比較典型的有 Blanz 和 Gish 利用前向三層網(wǎng)絡(luò)來解決分類問題。Babaguchi 等則使用多層網(wǎng)絡(luò)且使用 BP 算法對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練,在他們的方法中,輸入為圖像的直方圖,輸出為閾值分割的閾值。神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法的出發(fā)點(diǎn)是將圖像分割問題轉(zhuǎn)化為諸如能量最小化、分類等問題,其基本思想是用訓(xùn)練集對(duì) AN

93、N 進(jìn)行訓(xùn)練,以確定節(jié)點(diǎn)的連接和權(quán)值,再用訓(xùn)練好的 ANN 去分割新的圖像數(shù)據(jù)。其缺點(diǎn)是需要大量的訓(xùn)練集,在實(shí)際中往往是比較困難,并且使用目前的串行計(jì)算機(jī)去模擬 ANN 的并行操作,計(jì)算時(shí)間往往達(dá)不到要求。同時(shí)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)存在巨量的連接 ,容易引入空間信息,能較好地解決圖像中的噪聲和不均勻問題,選擇何種網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)是這種方法要解決的主要問題。</p><p>  2-2-7 基于知識(shí)的圖像分割</p>&l

94、t;p>  基于知識(shí)的分割是醫(yī)學(xué)圖像分割中重要的方法之一。近年來,隨著人工智能技術(shù)的發(fā)展,基于知識(shí)的分割方法得到了廣泛的應(yīng)用。基于知識(shí)的分割方法主要包括兩方面:知識(shí)的獲取,即歸納及提取相關(guān)</p><p><b>  8</b></p><p>  河北工業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文</p><p>  的知識(shí)、建立知識(shí)庫;知識(shí)的應(yīng)用,即有效地利用

95、知識(shí)實(shí)現(xiàn)圖像的自動(dòng)分割。該方法將臨床知識(shí)、器官的解剖學(xué)和形態(tài)學(xué)信息融合到分割算法中,提高了算法魯棒性?;谥R(shí)的分割方法存在的問題是缺乏完整的知識(shí)模型及快速的邏輯推理體系。</p><p>  §2-3 目前醫(yī)學(xué)圖像分割算法中存在的問題</p><p>  目前,醫(yī)學(xué)圖像分割技術(shù)的研究已經(jīng)取得了大量的成果,許多卓有成效的分割方法已在臨床中得到了成功應(yīng)用,但這一領(lǐng)域仍存在許多值得探

96、討的問題,主要表現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:</p><p>  大部分方法仍處在半自動(dòng)狀態(tài),還需要一定的人機(jī)交互,因此,如何盡量減少或排除人工干預(yù),提高算法的自動(dòng)化程度是目前值得研究的一個(gè)問題。</p><p>  大部分算法的復(fù)雜度高,運(yùn)行時(shí)間長,對(duì)硬件的要求較高,往往需要在工作站上執(zhí)行,這給應(yīng)用帶來了一定困難。因此研究高性能、低復(fù)雜度的快速分割算法非常重要。</p><p&

97、gt;  目前的許多分割算法分割的準(zhǔn)確度不是很令人滿意,進(jìn)一步提高分割準(zhǔn)確度也是目前許多研究者致力解決的問題。</p><p>  醫(yī)學(xué)圖像成分復(fù)雜,分割相對(duì)困難,并且圖像中往往具有大量噪聲、偽影干擾,因此要求算法具有較高的抗干擾性和魯棒性,目前的分割算法在這一方面往往具有一定缺陷,常出現(xiàn)過分割和欠分割問題。</p><p>  單一分割方法往往具有很多限制,如何綜合利用目前的方法,使其揚(yáng)

98、長避短、發(fā)揮自身優(yōu)勢(shì)是目前醫(yī)學(xué)圖像分割方法的研究熱點(diǎn)。</p><p><b>  9</b></p><p>  規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的三維醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)可視化研究</p><p>  第三章 規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的醫(yī)學(xué)圖像分割算法研究</p><p><b>  §3-1 引言</b></p>

99、<p>  醫(yī)學(xué)圖像分割是醫(yī)學(xué)圖像可視化領(lǐng)域的研究重點(diǎn),是體數(shù)據(jù)提取和不同組織器官可視化的技術(shù)基礎(chǔ),有很重要的實(shí)用價(jià)值。水平集(Level Set)算法是當(dāng)前比較流行的分割算法,對(duì)該算法進(jìn)行了深入的研究和探討,提出了一種水平集快速行進(jìn)法和窄帶法相結(jié)合的分割方法。使規(guī)則數(shù)據(jù)場(chǎng)的感興趣區(qū)域分割更快更精確,并根據(jù)腫瘤的特性和其所處的環(huán)境,詳細(xì)說明了種子點(diǎn)的選取方法。該方法把快速法得到的邊緣輪廓作為劃分窄帶的基準(zhǔn),在邊緣已有的基礎(chǔ)上劃

100、定窄帶區(qū)域,這樣可以提高分割速度,而且其邊緣定位也非常清晰,在邊緣和區(qū)域的準(zhǔn)確分割結(jié)果中甚至超過了醫(yī)生的手動(dòng)分割效果。</p><p>  §3-2 水平集方法</p><p>  3-2-1 水平集理論</p><p>  水平集(Level Set)方法以曲線演化理論為基礎(chǔ),是處理封閉運(yùn)動(dòng)界面隨時(shí)間演化過程中幾何拓?fù)渥兓挠行У挠?jì)算工具。Osher[3

101、6]在1988年首先提出依賴于時(shí)間的運(yùn)動(dòng)界面的水平集模型。其主要思想是將移動(dòng)的界面作為零水平集嵌入高一維的水平集函數(shù)中,這樣由閉超曲面的演化方程可以得到水平集函數(shù)的演化方程,而嵌入的閉超曲面總是其零水平集,最終只要確定零水平集即可以確定界面演化的結(jié)果 。該方法可以有效地解決拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)改變問題。目前已在圖像處理和計(jì)算機(jī)視覺等領(lǐng)域得到廣泛的應(yīng)用。比如,Sethian[37]等人用水平集方法去除圖像噪聲;Malladi[38]將其應(yīng)用于圖像分割

102、,特別是醫(yī)學(xué)圖像的分割和重建中;Bertalmio[39]等人將水平集方法應(yīng)用于圖像變形和破損圖像的恢復(fù)中;Masouri[40]將水平集方法用于運(yùn)動(dòng)目標(biāo)跟蹤領(lǐng)域;Paragios和Deriche[41]用水平集方法進(jìn)行紋理分割以及運(yùn)動(dòng)目標(biāo)分割和跟蹤;Samson[42]等人用水平集方法實(shí)現(xiàn)圖像分類等。</p><p>  首先我們來看一下主動(dòng)輪廓線方法的原理。通過主動(dòng)輪廓線(Active Contours)對(duì)圖

103、像 I 進(jìn)行分割,也常被稱為Snakes[43],屬于參數(shù)化可變性模型,主要是通過能量函數(shù)來控制初始輪廓線 C( p) ,</p><p>  p [0,1] 的演化。輪廓線的形變受到內(nèi)部力和外部力的影響,在高梯度區(qū)域到達(dá)能量最小的狀態(tài)。主動(dòng)輪廓線的范型能量函數(shù)的表達(dá)形式如下:</p><p>  公式(3.1)中,( , , )均為正參數(shù),前兩個(gè)條件定義可變形模型的內(nèi)部能量,控制輪廓線的

104、嚴(yán)格性和彈性,后一個(gè)條件通過定義模型的外部能量將模型引導(dǎo)到圖像中的高梯度區(qū)域。</p><p>  Osher和 Sethian提出了可以將平面閉合曲線隱含地表達(dá)為三維連續(xù)曲面 ( x, y) 的具有相同函數(shù)值的同值曲線。水平集方法將閉合曲線隱含地表達(dá)為高一維的曲面函數(shù)的水平集,即具有相同函數(shù)值的點(diǎn)集,通過水平集函數(shù)曲面的演化來隱含地求解曲線的運(yùn)動(dòng)。 為 Level Set 函數(shù),設(shè)給定的平面上有一條封閉的演化曲

105、線 C(t) ,以曲線為邊界,把整個(gè)平面劃分為兩個(gè)區(qū)域:曲線的外部區(qū)域和內(nèi)部區(qū)域。C(0)是沿著矢量場(chǎng)的法線方向進(jìn)行傳播的初始閉合曲線,速度依賴于曲率 k。在平面上定義一個(gè)符號(hào)距離函數(shù)(Signed Distance Function ,SDF) ( x, y, t) = d ,其中 d 是點(diǎn) ( x, y) 到曲線的最短距離,函數(shù)</p><p>  的符號(hào)取決于該點(diǎn)在曲線的內(nèi)部還是外部,一般定義在曲線內(nèi)部點(diǎn)的

106、距離為負(fù)值; t表示時(shí)間。這樣,在任意時(shí)刻,曲線上的點(diǎn)就是距離函數(shù)值為 0 的點(diǎn)(即距離函數(shù)的零水平集)。如圖 3.1 所示, 滿足 : ( x, y, t) 0 ,在 C(t)內(nèi); ( x, y, t) 0 ,在 C(t) 外; ( x, y, t) 0 ,在 C(t)上。圖 3.2[36]是平面上一個(gè)圓的 Level Set 函數(shù),為了看得清楚,此處將距離函數(shù)的正負(fù)號(hào)反轉(zhuǎn)了。</p><p><b>

107、;  10</b></p><p>  河北工業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文</p><p>  圖 3.1 曲線演化與水平集函數(shù)</p><p>  Fig. 3.1 Curve evolution and level set function</p><p>  圖3.2 圓的Level Set函數(shù)</p><p>

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