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1、PLIN1基因編碼的脂滴包被蛋白是脂滴表面含量最豐富的蛋白,是調(diào)控脂類(lèi)代謝的“分子開(kāi)關(guān)”。脂肪沉積性狀是判定豬肉質(zhì)優(yōu)劣的重要指標(biāo),目前關(guān)于PLIN1基因的研究多集中于人類(lèi)脂代謝綜合征上,有關(guān)豬PLIN1基因的報(bào)道較少。開(kāi)展PLIN1基因與豬脂肪性狀的相關(guān)性研究,并進(jìn)一步在形態(tài)學(xué)基礎(chǔ)上對(duì)所得結(jié)果進(jìn)行分析,可拓展豬脂肪沉積機(jī)理的研究范圍,為推動(dòng)豬脂肪沉積機(jī)理的早日揭示打下基礎(chǔ)。
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2、用常規(guī)方法測(cè)定背膘厚、肌內(nèi)脂肪含量、大理石花紋、剪切力等脂肪沉積相關(guān)性狀并采集樣品。運(yùn)用PCR-SSCP法對(duì)豬PLIN1基因第2、4外顯子進(jìn)行SN-P篩查,采用一般線(xiàn)性模型分析所得基因型對(duì)脂肪沉積性狀的影響作用。運(yùn)用組織形態(tài)學(xué)分析方法進(jìn)一步對(duì)PLIN1基因多態(tài)與脂肪性狀的相關(guān)性結(jié)果進(jìn)行分析。運(yùn)用多種生物信息學(xué)分析工具分析和預(yù)測(cè)豬PLIN1基因及其蛋白物種間的同源性及結(jié)構(gòu)、功能。
結(jié)果顯示,在豬PLIN1基因第2、4外顯子分
3、別發(fā)現(xiàn)一處堿基替換突變。第2外顯子的AA型背膘厚極顯著高于AB和BB型(P<0.01),而AA型剪切力值極顯著低于AB型和BB型(P<0.01);第4外顯子的CD型背膘厚顯著高于CC型(P<0.05),CD型肌內(nèi)脂肪含量極顯著高于CC型(P<0.01)。進(jìn)行冰凍切片及數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)脂肪面積百分?jǐn)?shù)與肌內(nèi)脂肪含量、大理石花紋呈正相關(guān)(P<0.05),肌內(nèi)脂肪含量與大理石花紋呈正相關(guān)(P<0.01);脂肪面積百分?jǐn)?shù)與肌內(nèi)脂肪含量回歸關(guān)系顯著,呈
4、二次方關(guān)系;PLIN1AA型和AB型脂肪面積百分?jǐn)?shù)比BB型高,CD型比CC型高。生物信息學(xué)結(jié)果分析顯示豬PLIN1基因與馬、牛、綿羊、人、黑猩猩、狨、鴨嘴獸、小鼠、雞的同源性達(dá)到89%、88%、87%、86%、86%、85%、82%、82%、77%;豬PLIN1蛋白含有多個(gè)磷酸化位點(diǎn),并且含有多個(gè)疏水區(qū);密碼子偏愛(ài)性分析發(fā)現(xiàn)第2、4外顯子突變導(dǎo)致了PLIN1基因選擇使用頻率不同的密碼子。
結(jié)果表明,豬PLIN1基因第2、4
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