羅非魚ICER和PGRN基因cDNA序列及表達分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、研究對奧尼羅非魚(Oreochromis.niloticus×O.aureus)、尼羅羅非魚(O.niloticus)、奧利亞羅非魚(O.aureus)和吉富羅非魚(GIFT)的抗病力進行了比較。通過對4種羅非魚進行鏈球菌(Streptococcus iniae,0.2×107CFU)攻毒實驗,發(fā)現(xiàn)奧尼羅非魚、尼羅羅非魚、奧利亞羅非魚和吉富羅非魚的死亡率分別為40.00%,48.00%,60.00%和76.00%。研究通過對羅非魚外周血

2、白細胞cDNA文庫測序所得序列進行生物信息學分析,獲得羅非魚cAMP誘導早期抑制因子(inducible cAMP earlyrepressor,ICER)全長cDNA序列(GenBank登陸號為ACS88195)和顆粒蛋白前體(progranulin,PGRN)全長cDNA序列(GenBank登陸號為GQ241348)。其中,ICER cDNA克隆總長569bp,包含1個完整的開放閱讀框,編碼111個氨基酸。序列表現(xiàn)出ICERⅡγ的基

3、本結構特征,即僅有cAMP應答元件調(diào)控因子(CREM)亮氨酸拉鏈DNA結合結構域DBDⅡ,且無外顯子γ。PGRN cDNA克隆總長843bp,包含一個完整的開放閱讀框,編碼206個氨基酸,其中推定信號肽20氨基酸,兩個GRN重復單位均56氨基酸。鑒于ICER和PGRN基因在魚類免疫和生長發(fā)育調(diào)節(jié)中的重要作用,研究采用實時熒光定量PCR方法對奧尼雜交羅非魚、尼羅羅非魚、奧利亞羅非魚和吉富羅非魚免疫和攻毒后ICER和攻毒后PGRN的表達進行

4、定量分析。結果顯示,攻毒后4種魚的腦、肝、頭腎和脾組織的ICER表達量均不同程度下調(diào),免疫后4種魚的腦、肝、前腎和脾組織ICER表達量均是先大幅下調(diào),7d后又轉(zhuǎn)為上調(diào)。另外,攻毒后ICER整體表達量和免疫后期ICER上調(diào)幅度在奧尼雜交羅非魚、尼羅羅非魚、奧利亞羅非魚和吉富羅非魚中呈依次下降,與4種羅非魚的實驗室抗鏈球菌感染能力和生產(chǎn)上抗病力呈正相關。PGRN mRNA在攻毒后4種羅非魚4種組織中表達均有上調(diào)趨勢,并且在脾中的表達量最高,

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