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文檔簡介
1、角蛋白14(Keratin14,KRT14,K14)作為哺乳類動物絨毛結構蛋白,與角蛋白5成對表達于表皮基底層細胞、絨毛及毛囊外根鞘細胞內,是覆層鱗狀上皮的生物標記物。因此我們對內蒙古白絨山羊角蛋白14啟動子進行了相關研究。
試驗一:內蒙古白絨山羊角蛋白14啟動子的克隆和分析。本試驗以內蒙古白絨山羊DNA為模板,參照牛的角蛋白14序列設計和合成引物,通過PCR擴增獲得長度為2834bp(登錄號為JQ063036),包括啟動子區(qū)
2、2631bp和結構基因第一外顯子區(qū)203bp的內蒙古白絨山羊角蛋白14基因片段,對角蛋白14基因啟動子結構進行了生物信息學分析,并與人和牛角蛋白14啟動子序列做了比對。結果:山羊角蛋白14啟動子結構與人角蛋白14啟動子只含有Sox-5,GATA-1,GATA-1/2結合位點等3個共同的轉錄因子結合位點;但與牛的有較高的相似性,含有Sox-5,SRY,Cdx A,Myo D,MZF1,GATA-1/3,Nkx-2結合位點等7個共同的轉錄因
3、子結合位點。
試驗二:內蒙古白絨山羊角蛋白14基因單核苷酸多態(tài)性分析。①在對內蒙古白絨山羊角蛋白14啟動子序列克隆的基礎上,首先以20只山羊混合DNA為模板通過克隆測序尋找多態(tài)位點,結果發(fā)現(xiàn)引物 D2和D4擴增片段-421和-1838處出現(xiàn)套峰。②在-421和-1838處分別設計引物S1和S2,以150頭內蒙古白絨山羊為研究對象,應用PCR-SSCP技術和DNA測序技術檢測內蒙古白絨山羊角蛋白14啟動子的分子變異。結果:引物S
4、1擴增產物有AA、AG、GG3種基因型;引物S2擴增產物有CC、CT、TT3種基因型;克隆測序分析,發(fā)現(xiàn)-421和-1838位點分別發(fā)生了A→G和C→T的堿基突變。③群體遺傳學表明:經χ2檢驗。-421(A→G)和-1838(C→T)位點上的SNP均處于Hardy-Weinberg(P>0.05)平衡狀態(tài),且均屬中度多態(tài)。-421(A→G)位點AA型個體的絨厚顯著低于GG型和AG型個體,GG型個體的絨長顯著高于AA型個體;-1838(C
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