基于計算系統生物學擬南芥花粉管與柱頭乙醇代謝耦合模型.pdf

1、植物傳粉與受精是種子和果實產生及作物產量形成的基礎，闡明植物傳粉與受精的調控機制是生殖與發(fā)育生物學研究領域重要和熱點問題之一。
　　本文以模式植物“擬南芥”作為研究對象:
　　(1)收集、整理擬南芥已有的代謝途徑數據庫及擬南芥花粉管與柱頭互作過程中的多組學數據;
　　(2)依據生物生化反應方程式及代謝互作網絡構建模式，構建了擬南芥全基因代謝互作網絡模型;
　　(3)依據擬南芥花粉管與柱頭互作過程中的全基因轉錄組數

2、據，分別挖掘出擬南芥花粉管和柱頭在授粉過程中特異表達的基因，并進一步找到了這些特異表達基因所編碼的酶;
　　(4)然后根據代謝網絡模型構建規(guī)則，將花粉管和柱頭中差異基因編碼的酶匹配到已構建的擬南芥全基因代謝互作網絡中，提取出由差異基因編碼的酶構成的子網絡;
　　(5)再采用網絡拓撲中節(jié)點的關聯性、中心節(jié)點等網絡拓撲分析方法，得到了擬南芥花粉管中乙醇二級代謝和檸檬酸循環(huán)代謝途徑上的特異表達的酶基因以及柱頭中糖酵解代謝途徑上的特