豬戊型肝炎病毒swCH189株全基因組序列克隆及ORF2的原核表達(dá).pdf_第1頁(yè)
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1、本研究設(shè)計(jì)7對(duì)PCR套式引物，應(yīng)用RT-PCR方法及RACE末端擴(kuò)增法，分片段擴(kuò)增了豬戊型肝炎病毒甘肅省分離株swCH189全基因組序列。swCH189基因組長(zhǎng)為7284nt，GenBank登錄號(hào)FJ610232，除3’端poly（A）尾外，基因組長(zhǎng)為7171nt，共有3個(gè)ORFs，ORF1長(zhǎng)5124bp，編碼1708aa。ORF2長(zhǎng)2025bp，編碼674aa，ORF3長(zhǎng)345bp，編碼114aa。其基因組結(jié)構(gòu)特征與HEV基因Ⅳ型一致

2、。HEVswCH189株與其他毒株全基因組序列核苷酸同源性為73.7%～89.6%；ORF2核苷酸同源性為79.1%～91.8%. swCH189株ORF1與已報(bào)道的Ⅰ～Ⅲ型毒株的ORF1氨基酸同源性為78.8%～86.9%，而與Ⅳ型毒株的同源性達(dá)93.7%～97.6%。swCH189株ORF2與已報(bào)道的Ⅰ～Ⅲ型毒株的氨基酸同源性為87.5%～92.4%，與Ⅳ型毒株的同源性為95.9～98.2%。swCH189株ORF3與已報(bào)道

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