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文檔簡介
1、本研究比較了兩種基因組提取方法對調查沉積物中細菌群落垂向特征的影響,并研究了中營養(yǎng)化湖泊洱海的不同湖區(qū)沉積物中細菌群落組成,功能與不同有機質來源的關系。研究中我們利用了PCR-變形梯度凝膠電泳技術(DGGE),碳同位素(δ13C)和碳氮原子比測定以及典范對應分析(CCA)來研究沉積物中細菌群落進化與環(huán)境變量的關系,特別是與有機質來源的關系。我們的實驗結果表明不同的基因組提取方法對產生的細菌群落組成信息具有顯著的影響,但不會影響底泥垂向群
2、落結構與環(huán)境變量關系的評價,方法導致的核酸產量差異主要體現(xiàn)在深層底泥中。另外不同湖區(qū)的沉積物細菌群落垂向變化受不同環(huán)境因子的影響,但是有機質來源在不同區(qū)域對構建細菌群落組成都發(fā)揮了重要作用。伴隨著陸源C4植物來源有機質含量增長,Delta-變形桿菌(Deltaproteobacteria)的豐度會下降。本研究對DGGE條帶進行了克隆測序,結果表明洱海底泥中大多數(shù)細菌屬于:Delta-變形桿菌(Deltaproteobacteria),厚
3、壁菌(Firmicutes)綠屈撓菌(Chloroflexi)。Beta-變形桿菌(Betaproteobacteria)只做為上層底泥優(yōu)勢菌而出現(xiàn)。本研究對沉積物細菌群落組成分析也表明洱海北部的營養(yǎng)化程度相對其他區(qū)域更高。細菌群落的香農威爾多樣性指數(shù)和功能也直接受到有機質來源影響,恒定的有機質來源會產生穩(wěn)定的,多樣化程度更高的細菌群落以及更廣泛的利用有機質的能力和策略??偠灾毦郝涠鄻有圆町惡艽蟪潭壬蠚w因于環(huán)境變化后不同的有機質
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