中國小型豬SLA微衛(wèi)星的遺傳多樣性研究.pdf

1、本試驗采用SLA區(qū)域18對微衛(wèi)星引物對豬群體遺傳多態(tài)性進行了檢測，首先探討了華南型的滇南小耳豬、巴馬小型豬、從江香豬、五指山豬、明光小耳豬，高原型的合作豬，華北型荷包豬以及東北野豬、華南野豬、云南野豬共10個群體346頭小型豬的遺傳多樣性；其次檢測了藏豬紅毛單系、從江香豬家系以及藍塘豬家系共6個群體的遺傳多樣性。通過計算等位基因數(shù)(Na)、遺傳雜合度(H)、多態(tài)信息含量(PIC)、單倍型分型等指標來衡量不同群體SLA的遺傳多態(tài)性，在群體

2、間遺傳多樣性的分析中采用AMOVA檢驗、Fst值、鄰近結合法進行聚類分析?？傮w結果概述如下：
　　 1.比較了SLA基因群內不同區(qū)域的18個微衛(wèi)星多態(tài)性情況，發(fā)現(xiàn)Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ類區(qū)域的微衛(wèi)星多態(tài)性逐漸降低，PIC分別為0.6626，0.5309,0.4619，著絲粒附近的多態(tài)性最低，其PIC為0.1739。
　　 2.在6個家系群體內共檢測到143個等位基因，有5個座位的等位基因數(shù)多達10個以上；有2個座位的等位基因數(shù)較低，

3、其中SLAMS057僅有2個等位基因，SLAMS094為純合狀態(tài)；藏豬紅毛單系的等位基因數(shù)均高于從江香豬家系及藍塘豬的4個家系，而從江香豬家系及藍塘豬4個家系的等位基因數(shù)差別不明顯。
　　 3.10品種小型豬群體間比較，發(fā)現(xiàn)華南型小型豬之間、華南型小型豬與過渡型明光小耳豬分化程度較?。粬|北荷包豬與華南型大部分小型豬、3品種野豬存在較大的分化，而荷包豬與合作豬屬于中等程度的分化。通過親緣聚類分析發(fā)現(xiàn)明光小耳豬首先與滇南小耳豬聚合，

4、再與其它華南型小型豬種聚合成一類，由此可以將明光小耳豬歸為華南型小型豬品種；另外，華北型2品種小型豬聚為一類，高原型豬種獨聚一類。7品種小型家豬群體內進行遺傳多樣性（以PIC含量為準）比較，最高的為滇南小耳豬(0.6396)，其次為明光小耳豬(0.6356)，五指山豬(0.6033)、巴馬香豬(0.5947)，合作豬(0.5930)、從江香豬(0.5476)、最低為華北型的荷包香豬(0.4330)；在家系群體內，3品種豬家系的個體基本按

5、品種聚合在一起，但也發(fā)現(xiàn)部分個體(Tr003,LTB001等)混合于其他群體而出現(xiàn)了交叉混群現(xiàn)象。
　　 4.在單倍型研究中，SLA-I類區(qū)域得到10種單倍型，其中有4種為主單倍型；Ⅱ類區(qū)域也得到了10種單倍型，且發(fā)現(xiàn)這些單倍型的頻率在10.938％～21.184％之間：在Ⅲ類區(qū)域發(fā)現(xiàn)11種倍型，其中有4種主單倍型；綜合Ⅰ-Ⅲ類區(qū)域的6個微衛(wèi)星進行單倍型分型共得到9種單倍型，其中有4種為重組單倍型，重組發(fā)生的位點均出現(xiàn)在Ⅰ、Ⅲ類

6、區(qū)域，Ⅱ類區(qū)域未曾發(fā)現(xiàn)重組的位點。在家系群體內，在SLAI類區(qū)域共得到10種單倍型，其中有3種單倍型為主單倍型：其頻率高低依次為Hp11.1＞Hp11.5=Hp11.7；在Ⅱ類區(qū)域共得到12種單倍型，其中有3種為主單倍型，其頻率高低依次為Hp10.1＞Hp10.4＞Hp10.7；最后通過對Ⅰ-Ⅱ類區(qū)域的8個微衛(wèi)星進行分型共得到11種單倍型，其中有5種單倍型為重組單倍型。
　　 5.在藍塘豬家系和藏豬紅毛單系內的SLAMS034,