小麥族植物L(fēng)TP基因系統(tǒng)進(jìn)化研究.pdf

1、高等植物脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(lipid-transfer proteins，LTPs)是一類(lèi)小分子量堿性單體蛋白質(zhì)。LTP能夠在生物膜之問(wèn)轉(zhuǎn)運(yùn)磷脂，參與細(xì)胞內(nèi)生物膜的形成。LTP還參與形成角質(zhì)與臘質(zhì)，因此其與植物的抗病性和抗逆性相關(guān)。目前已報(bào)道多種植物L(fēng)TP基因序列，且已純化出LTP蛋白。本研究從Au、Am、D、Eb、Ee、F、H、I、M、N、Ns、P、O、Q、R、St、Ss、Sl、Ssh、Ta、CD、AG和ABD等不同基因組組成的31份小麥

2、族材料中克隆LTP基因，并進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析，獲得以下結(jié)果：
　　 1、獲得LTP基因86個(gè)。其中大麥LTP基因編碼區(qū)長(zhǎng)為354bp，其他材料基因組克隆獲得的LTP基因編碼區(qū)長(zhǎng)度均為348bp。核酸序列多重比對(duì)結(jié)果表明相同材料克隆獲得的不同LTP基因序列問(wèn)相似件為89.94％～100％，從D、Au、Am、F、I、H和ABD基因組克隆的序列相似性分別為100％。LTP基因與NCBI已報(bào)道序列一致性為88％～100％。相比于非編碼區(qū)，

3、編碼區(qū)核酸序列比較保守，序列相似性為92.56％。變異類(lèi)型主要發(fā)生在30～130bp區(qū)間堿基T與C間，共38次。大麥LTP基因序列在3′端終止密碼子前有一個(gè)ATTTAC插入突變。
　　 2、大麥LTP基因推導(dǎo)的氨基酸序列包含117個(gè)氨基酸殘基，其他材料基因組克隆LTP基因推導(dǎo)的氨基酸序列包含115個(gè)氨基酸殘基，分子量介于11807Da～12281Da間，蛋白一級(jí)結(jié)構(gòu)相似性為86.70％。N端都含有長(zhǎng)26個(gè)氨基酸殘基的信號(hào)肽。根據(jù)

4、半胱氨酸殘基(C)的數(shù)目、位置和二硫鍵形成方式可將LTP基因分為三類(lèi)：從Au、Am、AG和F基因組克隆獲得的LTP歸為第一類(lèi)，半胱氨酸C29與C74、C39與C53、C54與C98和C76與C113間分別形成二硫鍵；從CD、D、Eb、F、H、I、M、N、Ns、P、Q、R、St、Ss、Sl、Ssh、O、Ta和ABD基因組克降獲得的LTP歸為第二類(lèi)，半胱氨酸C29與C76、C39與C53、C54與C98和C74與C113間分別形成二硫鍵；從

5、O基因組的亨氏草屬（Henrardia persica）克隆獲得的LTP18-P和LTP19-P第75位氨基酸為賴(lài)氨酸(K)，是一個(gè)堿性氨基酸，以上所有LTP都含有8個(gè)位置保守的半胱氨酸，分別位于29、39、53、54、74、76、98和113位。從O基因組克隆獲得的LTP17-P含有10個(gè)半胱氨酸分別位于29、39、53、54、58、76、86、94、99和113位，歸為第三類(lèi)。
　　 3、推導(dǎo)的氨基酸序列同源聚類(lèi)分析表明：來(lái)

6、自D、N、Ssh、ABD、Au、P、Am、AG、S1、M、CD、Ss、St、F和Ta,Eb、Ss、St、Ee、O、F和R,I和H.M、P、Ssh、Ns、Q、H和Ta基因組LTP分別聚為一類(lèi)，O基因組的LTP17-P單獨(dú)聚為一類(lèi)。系統(tǒng)進(jìn)化聚類(lèi)分析表明：Eb、Ee和Ns，ABD、D、N、Ssh、Sl、AG、Am、Au、F、M、CD、Ss、Ta和R，H、I、P、Q和St基因組分別聚為一類(lèi)；O基因組單獨(dú)聚為一類(lèi)。聚為同一類(lèi)的基因組相互問(wèn)可能存在