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文檔簡介
1、第三篇 醫(yī)學統(tǒng)計學方法,2013.11.6,3,主講人 陶育純,實習1,,,,http://cc.jlu.edu.cn/ms.htmlhttp://cc.jlu.edu.cn/ss.html,醫(yī)學統(tǒng)計學方法,流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學教研室,2013.11.6,4,第三講,課程名稱:預防醫(yī)學主要教材: «衛(wèi)生學» 第7版 仲來福 主編 人民衛(wèi)生出版社年級、專業(yè)
2、:2011級醫(yī)學五年制第一教班授課時間:2013年11月7日授課時數:4h,2013.11.6,5,目錄,一、小結,二、統(tǒng)計分析工具的介紹,三、課堂實習,四、課堂講解,五、課后作業(yè),1. 統(tǒng)計軟件的簡介2. SAS的基本使用方法(自學)3. SPSS的基本使用方法★4. Excel的統(tǒng)計分析方法5. Android系統(tǒng)的統(tǒng)計應用,2013.11.6,6,一、小結,統(tǒng)計學醫(yī)學統(tǒng)計學,醫(yī)學統(tǒng)計學基本概念,一、變量,㈠ 數值變量
3、(定量變量、計量資料)㈡ 分類變量(定性變量、計數資料),隨機性,變量,變量值,等級資料,2013.11.6,7,二、同質與變異三、總體與樣本四、參數與統(tǒng)計量五、抽樣誤差(見后)六、概率,醫(yī)學統(tǒng)計工作的基本步驟,一、設計,隨機化原則,頻率,小概率事件,㈢ 變量間的轉化,2013.11.6,8,二、收集資料三、整理資料四、分析資料,統(tǒng)計描述,統(tǒng)計推斷,統(tǒng)計表與統(tǒng)計圖,㈠、統(tǒng)計表的結構㈡、統(tǒng)計表的種類㈢、制表原則和基本要求
4、⑴ 標題,一、統(tǒng)計表,2013.11.6,9,⑵ 表號 ⑶ 表線 ⑷ 縱標目 ⑸ 橫標目 ⑹ 數字 ⑺ 備注 ㈣、統(tǒng)計表的繪制方法,二、統(tǒng)計圖,㈠、繪制統(tǒng)計圖的基本要求,2013.11.6,10,㈡、常用統(tǒng)計圖的繪制方法及注意事項 ⑴ 條圖 ⑵ 百分條圖 ⑶ 圓圖 ⑷ 線圖 ⑸ 半對數線圖 ⑹ 散點圖 ⑺ 直方圖 ⑻ 統(tǒng)計地圖,2013.11.6,11,定量變量資料的統(tǒng)計描述,分布,㈠、頻數分布表㈡、頻
5、數分布圖㈢、頻數分布特征,直方圖,集中趨勢,離散趨勢,一、定量變量資料的頻數分布,㈣、頻數分布類型㈤、頻數分布表的用途,對稱分布,偏峰分布,2013.11.6,12,二、平均水平指標,㈠、算術均數(均數),㈡、幾何均數㈢、中位數,百分位數:,組中值,1. 直接法 2. 間接法,三、離散程度指標,㈠、全距(極差)㈡、四分位數間距,R = max - min,2013.11.6,13,㈢、方差㈣、標準差㈤、變異系數,離
6、均差平方和,正態(tài)分布及其應用,一、正態(tài)分布? 正態(tài)分布的特征1、正態(tài)曲線下面積分布規(guī)律2、標準正態(tài)分布,N(μ,σ2),N(0,1),,u變換,μ±1.96σ 95%μ±2.58σ 99%,,,,,,2013.11.6,14,3、醫(yī)學參考值范圍的估計① 確定醫(yī)學參考值范圍的注意事項② 醫(yī)學參考值范圍的計算方法 1) 正態(tài)分布法 2) 百分位數法,注意聽呦,下面的內容比我手里的東西還重要??!
7、,2013.11.6,15,二、統(tǒng)計分析工具的介紹,1. 統(tǒng)計軟件的簡介,⑴ SAS,㈠ SAS簡介,SAS(Statistical Analysis System) 是當今世界上最權威的統(tǒng)計分析系統(tǒng)之一。SAS系統(tǒng)于上世紀六十年代末由美國的North Carolina大學的一 個研究小組開發(fā)。1976年成立SAS研究所專門負責產品的研制、生產、銷售和培訓。1985年首次推出PC版本,以后相繼推出升級版本,功能不 斷加強,目前最新版
8、本為SAS V9.4。,2013.11.6,16,www.sas.com,你可以花錢使用SAS,但你不能擁有它!,2013.11.6,17,Today, SAS is no longer a name of statistical software, it became a symbol of all products in business intelligence and analytical software and servi
9、ces provided by SAS company.,2013.11.6,18,2013.11.6,19,Look for the new SAS ads,What isMeaning ?,2013.11.6,20,Gophers burrow through life without seeing the havoc they create.,They can’t help having tunnel vision.But
10、you can. With proven business intelligence and analytic software from SAS.,2013.11.6,21,Another SAS ads,2013.11.6,22,SAS是一個模塊化、集成化的應用軟件系統(tǒng),它可以實現(xiàn)對數據的完全控制和充分利用。主要完成以數據中心的四大任務: ?數據訪問 ?數據管理 ?數據呈現(xiàn) ?數據分析,SAS可由許多不同的模塊組成來完成不
11、同的任務。對于最基本的、最常用的統(tǒng)計方法放在基本系統(tǒng)模塊(BASE)里,不管低版本還是高版本,此模塊都包含。 常用的模塊有:SAS/BASE(基礎)、SAS,2013.11.6,23,/STAT(統(tǒng)計)、SAS/GRAPH(圖形)、SAS/ETS(預測)、SAS/IML(矩陣)、SAS/QC(質量控制)等。,SAS的特點: ① 可靠性高 ② 易用性好 ③ 通用性強 ④ 應用范圍廣,㈡
12、SAS的啟動和操作界面,2013.11.6,24,啟動SAS有兩種方法:一是通過雙擊桌面上的SAS的快捷啟動方式圖標 ;二是通過單擊“開始”按鈕內“程序”下SAS系統(tǒng)程序組中的SAS的啟動程序項 。,SAS的操作界面是由標題、菜單、工具欄、窗口和狀態(tài)行構成。不同版本的界面稍有不同。以下圖1為SAS 6.12的操作界面,圖2為SAS 9.3 的操作界面。,2013.11.6,25,圖 1,2013.11.6,26,
13、圖 2,,2013.11.6,27,㈢ SAS的基本使用方法,SAS主要通過編程完成統(tǒng)計分析任務。,SAS Program,,數據步(DATA Step),過程步(PROC Step),SAS程序通過數據步完成SAS數據集(DataSet)的建立工作,此步還可對數據進行加工、整理和變換。通過過程步調用一個或多個SAS過程(procedure),其作用是對已建立的SAS數據集進行分析和管理。,2013.11.6,28,data
14、test2 ; input x y @@ ; d = x - y ;cards ;3550245020002400300018003950 32003800 3250375027003450250030501750; proc means mean std stderr t prt ; var d ;run ;,以下是一個SAS程序的樣例。,cus
15、tomer success stories,2013.11.6,29,SAS主要通過三個基本窗口,即程序編輯窗口(PROGAM EDITOR,簡記PGM)、日志窗口(LOG)和輸出窗口(OUTPUT)進行程序的輸入、編輯、運行以及運行過程信息和運行結果的查看、存儲。,以下是前述SAS程序樣例的運行過程信息和運行結果。,2013.11.6,30,有關SAS使用方法的參考書如下:,1. SAS for Windows 統(tǒng)計分析系統(tǒng)教
16、程 洪楠等編 電子工業(yè)出版社 2001,2013.11.6,31,2. Windows SAS 6.12 & 8.0實用統(tǒng)計分析教程 胡良平編 軍事醫(yī)學科學院 2001,3. 分類數據的統(tǒng)計分析及SAS編程 劉勤編 復旦大學出版社 2002,4. 醫(yī)用統(tǒng)計學中的SAS統(tǒng)計分析
17、 賀佳編 第二軍醫(yī)大學出版社 2002,5. 醫(yī)用統(tǒng)計學與電腦實驗(第二版) 方積乾編 上海科學技術出版社 2001,6. SAS 8.2統(tǒng)計應用教程 薛富波編 北京希望電子出版社 兵器工業(yè)出版社 2004,2013.11.6,32,⑵ SPSS,㈠ SPSS簡介,SPSS(Statistical Packa
18、ge For the Social Sciences) 是當今世界上最權威的統(tǒng)計分析系統(tǒng)之一。SPSS于上世紀七十年代初由美國的Stanford大學的一個研究小組開發(fā),以后成立SPSS公司專門負責產品的研制、生產、銷售和培訓。SPSS最初是為大型計算機開發(fā)的,隨著PC的發(fā)展與普及,相應地推出PC版本,以后相繼推出升級版本,功能不斷加強,目前最新版本為IBM SPSS Statistics 22。,2013.11.6,33,,WWW.S
19、PSS.COM ? www-01.ibm.com/software/analytics/spss/網站提供免費下載Trial版,但只能使用14天。WWW.SPSS.COM.CNSPSS的中國網站還可使用。,,正式版本的價錢 $ !,,又漲了100 $ !,只要你肯花錢, 你就能擁有它!,,2013.11.6,34,要想免費下載Trial版本, 你必須填寫個人信息單。你還可以下載許多用戶手冊。,2013.11.6,3
20、5,,,Enables you to apply more sophisticated models to your data using its wide range of non-linear modelling procedures.,,,Can provide Fisher’s Exact Test method.,Provides a powerful set of sophisticated univariate and
21、multivariate analytical techniques that you can apply to real-world problems.,2013.11.6,36,將來不叫SPSS,也不一定叫PASW,而可能叫IBM SPSS !,,,,2013.11.6,37,This is thelatest informationfor IBM SPSS software.,http://www-01.ibm.com/so
22、ftware/analytics/spss/products/statistics/,$4660 !,$2320 !,$6950 !,2013.11.6,38,SPSS公司已于2000年正式將英文全稱更改為Statistical Product and Service Solutions,意為“統(tǒng)計產品與服務解決方案”,標志著SPSS的戰(zhàn)略方向正在做出重大調整。,SPSS也是一個模塊化、集成化的應用軟件系統(tǒng)。它通過基本模塊BASE與其它
23、模塊相連,完成各種不同的統(tǒng)計分析任務。,SPSS最突出的特點就是操作界面極為友好,輸出結果美觀漂亮,它使用Windows的窗口方式展示各種管理和分析數據方法的功能,使用對話框展示出各種功能選擇項,只要掌握一定的,2013.11.6,39,Windows操作技能,粗通統(tǒng)計分析原理,就可以使用該軟件為特定的科研工作服務。是非專業(yè)統(tǒng)計人員的首選統(tǒng)計軟件。,SPSS是世界上最早采用圖形菜單驅動界面的統(tǒng)計軟件。它采用類似Excel表格的方式輸入
24、與管理數據,數據接口較為通用,能方便的從其他數據庫中讀入數據。其統(tǒng)計過程包括了常用的、較為成熟的統(tǒng)計方法,完全可以滿足非統(tǒng)計專業(yè)人士的工作需要。輸出結果十分美觀,存儲為專用的SPO格式,可以轉存為HTML格式和文本格式。,2013.11.6,40,2013.11.6,41,2013.11.6,42,㈡ SPSS的啟動和操作界面,啟動SPSS有兩種方法:一是通過雙擊桌面上的SPSS的快捷啟動方式圖標 ;二是通過單
25、擊“開始”按鈕內“程序”下SPSS系統(tǒng)程序組中的SPSS的啟動程序項 。,SPSS的操作界面是由標題、菜單、工具欄、窗口和狀態(tài)行構成。不同版本的界面稍有不同。以下圖3為SPSS 13.0的數據管理界面,圖4為分析結果的操作界面。,2013.11.6,43,圖 3,2013.11.6,44,圖 4,2013.11.6,45,㈢ SPSS的基本使用方法,與SAS不同,SPSS主要通過操作菜單來完成統(tǒng)計分析任務。 SPSS把所
26、有的統(tǒng)計分析功能分門別類地以命令、對話框和選擇項的形式放到菜單中。用戶使用統(tǒng)計功能只需點擊鼠標就可輕松完成,而不必費心編程。SPSS還提供了通過“粘貼”按鈕自動生成程序內容的先進、方便功能。 SPSS也必須首先建立數據集才可進行統(tǒng)計分,2013.11.6,46,析。通過在一個類似Excel表格的界面里建立包括變量在內數據文件。以下通過《衛(wèi)生統(tǒng)計學》第四版的第十三章回歸與相關中的例13.1資料,演示一下在SPSS 10.0中進行直
27、線回歸分析的操作過程及分析結果。,例13.1 某研究者為探討女性的年齡與收縮壓的關系,收集了某地12名婦女的年齡與收縮壓數據見下表。試求年齡與收縮壓的直線回歸方程。,2013.11.6,47,首先在SPSS的數據編輯窗口(Data Editor)中建立年齡與收縮壓的數據集。,,,2013.11.6,48,以下是年齡與收縮壓的變量設置窗口。,,,2013.11.6,49,以下是選擇繪制年齡與收縮壓的散點圖的菜單項。,2013.11.6,
28、50,以下是繪制年齡與收縮壓的散點圖的對話框。,,,2013.11.6,51,以下是年齡與收縮壓的散點圖的輸出結果。,2013.11.6,52,以下是選擇進行年齡與收縮壓的直線回歸分析的菜單項。,2013.11.6,53,以下是進行年齡與收縮壓的直線回歸分析的對話框。,,,2013.11.6,54,以下是年齡與收縮壓的直線回歸分析的輸出結果1。,2013.11.6,55,以下是年齡與收縮壓的直線回歸分析的輸出結果2。,有關SPSS使用方
29、法的參考書如下:,1. SPSS 與統(tǒng)計分析 宇傳華 主編 電子工業(yè)出版社 2007.2,,,,,t = 6.320, P < 0.001.,2013.11.6,56,2. 醫(yī)學統(tǒng)計學與SPSS 軟件應用 王彤 主編 北京大學醫(yī)學出版社 2008.8,3. SPSS統(tǒng)計分析基礎教程(第2版) 張文彤 等編 高等教育出版
30、社 2011.11,4. SPSS統(tǒng)計分析高級教程(第2版) 張文彤 等編 高等教育出版社 2013.3,5. SPSS在醫(yī)學科研中的應用 王樂三 主編 化學工業(yè)出版社 2007.7,6. SPSS(PASW)17.0在醫(yī)學統(tǒng)計中的應用(第四版) 馬斌榮 編著 科學出版社 2010.6,2013.11.6,57,2. SAS的基
31、本使用方法(自學),參見“SAS的基本使用方法.PPT”課件;參見“現(xiàn)代統(tǒng)計學與SAS應用.chm”已編譯的 HTML 幫助文件;參見關于SAS的使用方法的參考書。,2013.11.6,58,3. SPSS的基本使用方法 ★,⑴ SPSS基礎知識,㈠ SPSS的常用名詞和術語,1. 常數(constant) 在運行中保持不變的數據。如?、e等。2. 變量(variable) 變化數據的代表。SPSS對變
32、量有如下規(guī)定: ⑴ 變量名最多由8個字符組成(12.0以前版本),首字符必 須為字母或@, 其后可以是字母、數字、下劃線、句點、 $,#,但不允許把句點(.)作為變量名的尾字符。,2013.11.6,59,10.0版本以上可以取漢字變量名;12.0版本開始支持長 文件名,允許最長64個字符,但單詞之間不允許以空格 分隔。 ⑵ 變量有數值型與字符型。SPSS提供的8種類型中,前 七種均視為數值型。
33、 ⑶ 變量名不區(qū)分大小寫字母。 ⑷ 變量名不能使用SPSS的關鍵字。有: AND、OR、 NOT、ALL、TO、BY、EQ、GE、GT、 LE、LT、 NE、WITH。 ⑸ 變量名必須唯一,不允許重復。,2013.11.6,60,3. 表達式(expression) 用運算符和括號把常數、變量和函數按一定的規(guī)則連 接起來的有意義的式子。如: COMPUTE y=sin(x)
34、. COMPUTE x=x+1. SPSS用 ** 代表乘方運算符。 4. 關鍵字(keywords) SPSS定義的用于標識命令、子命令、函數、運算符和 其它設定的特殊詞匯。 5. 樣品(case) 是組成數據文件的基本單元。又稱記錄(record)或觀測( observation )。,2013.11.6,61,6. 缺失值(missing value) 指
35、統(tǒng)計中不合格項(因缺失或遺漏)或給出規(guī)定值以 外的數值。SPSS有系統(tǒng)缺失值和用戶缺失值兩種。SPSS 用句點(.)代表缺失值。,㈡ SPSS的常用函數,SPSS 12.0共提供12種類型177個常用函數(function)。 1. 算術函數(Arithmetic Functions) ABS(X) 取絕對值函數 RND(X) 四舍五入取整函數 TR
36、UNC(X) 取整函數(小數點后數字舍去),2013.11.6,62,SQRT(X) 平方根函數 EXP(X) ex LG10(X) lgx LN(X) lnx SIN(X) 正弦函數 COS(X) 余弦函數 等等
37、 2. 統(tǒng)計函數(Statistical Functions) SUM(X) 求和函數 SD(X) 求標準差函數 MEAN(X) 求算術平均數函數 SD(X) 求標準差函數 等等,2013.11.6,63,3. 轉換函數(Conversion Functions) NUMBER(str
38、expr,format) 把字符轉換成數值 STRING(numexpr,format) 把數值轉換成字符 其中format常取f?或f?.?格式,? 代表數字。 4. 日期和時間函數(Date and Time Functions) CTIME.DAYS(timevalue) 計算天數 XDATE.YEAR(datevalue) 返回四位整數年份
39、CTIME.SECONDS(timevalue) 計算秒數 DATE.DMY(day,month,year). Numeric in date format. Returns a date value corresponding to the indicated day, month, and year. To display this value correctly, assign it a DATE format.
40、The arguments must be integers, with day between 1 and 31, month between 1 and 13, and year a four-digit integer greater than 1582.. (1582年10月14日及更早的時間在SPSS中是無效的) 參見SPSS數據文件date.sav。 等等,2013.11.6,64,5. 字符串函數(Str
41、ing Functions) LENGTH(strexpr) 計算strexpr的長度(包括結尾的空格) LOWER(strexpr) 小寫轉換函數 等等 6. 隨機變量函數(Random Variable Functions) RV.NORMAL(mean, stddev) Numeric. Returns a random value from a norm
42、al distribution with specified mean and standard deviation. 等等 7. 缺失值函數(Missing-value Functions) NMISS(X[,…]) 計算變量中的缺失值的個數 等等 其它種類函數略,詳情請見SPSS的幫助文件。,2013.11.6,65,⑵ SPSS數據錄入和數據獲取,㈠ SPSS數據錄入,數據文件
43、的結構見圖5 。 ① 定義變量。即在變量編輯窗口(Variable View) 定義變量的十大屬性Name、Type、Width、Decimals、 Label、Values、Missing、Columns、Align、Measure。 ② 輸入數據。即在數據編輯窗口(Data View)錄入 原始數據。一列為一個變量,一行為一個記錄。 SPSS的數據文件經存儲后,其默認的文件名后
44、綴為: “ .sav” 。,2013.11.6,66,The structure of database,,,case,variable,One row, one case One column, one variable (index),圖 5,2013.11.6,67,,,2013.11.6,68,,,,2013.11.6,69,,Input code number,,Input the meanings that cod
45、e number indicates,sex,,1-male2-female,2013.11.6,70,Discrete missing values — 離散缺失值,2013.11.6,71,,,1-male2-female,,,1-A2-B3-AB4-O,2013.11.6,72,,,2013.11.6,73,2013.11.6,74,㈡ SPSS數據獲取,★,SPSS可以調入由其它軟件生成的數據文件。如常用的Excel
46、、dBASE等數據庫文件。 方法: File → Open → Data…,在打開的Open File對話框中打開“文件類型”下拉框,選擇外部數據文件相應的文件類型,再找到文件的相應存儲位置,即可找到并調入該數據文件。 SPSS可打開的數據文件類型參見圖2.8a。,2013.11.6,75,,2013.11.6,76,,,圖2.8a,2013.11.6,77,⑶ SPSS的描述統(tǒng)計分析方法,㈠
47、正態(tài)性檢驗,SPSS主要通過Analyze → Nonparametric Tests ? →1-Sample K-S…檢驗(即One-Sample Kolmogorov-Smirnov Test)完成對某變量所有數據的正態(tài)性檢驗。 下面通過對例5.1的數據做正態(tài)性檢驗來講述操作步驟及結果的判讀。 1. 建立數據文件(見exp5.1.sav),2013.11.6,78,2013.11.6,79,2. 正態(tài)性
48、檢驗 Analyze →Nonparametric Tests ?→1-Sample K-S…打開One-Sample Kolmogorov-Smirnov Test對話框。選擇檢驗變量并選擇? Normal(正態(tài)分布)選項, OK完成。 3. 結果判讀 輸出結果見表5.2,若Asymp. Sig. (2-tailed)的值大于檢驗水準(0.05),則該變量服從正態(tài)分布;反之不服從。,20
49、13.11.6,80,,被檢驗變量,,,,當被檢驗變量的例數小于30時,選擇此項可得到精確檢驗概率。,Uniform —均勻分布Poisson — 泊松分布Exponential — 指數分布,2013.11.6,81,,,即檢驗概率P,若P>0.05,則服從正態(tài)分布。,,,,,檢驗統(tǒng)計量Z,Sig.—Significance,即檢驗概率PAsymp.—Asymptotic, 近似的,只有選擇Exact選項時才有。,表
50、5.2,輸出結果,2013.11.6,82,㈡ 使用Frequencies命令,SPSS可以使用Frequencies命令完成對連續(xù)變量數據的頻數分布分析,可以繪制直方圖(histogram);對離散變量進行頻數列表并繪制直條圖(Bar chart)或餅圖( Pie chart );對數據可以求均數、標準差、最大值、最小值、標準誤、中位數和百分位數等。 方法: Analyze → Descriptive St
51、atistics ? → Frequencies …,2013.11.6,83,,,,,,列頻數表,,,值是組中值,,,任意百分位數的選擇,Bar chart — 條圖Pie chart — 餅圖Histogram — 直方圖,,2013.11.6,84,下面通過對例5.1的數據做基本統(tǒng)計分析來講述操作步驟及結果的判讀。 1. 打開數據文件(見exp5.1.sav) 2. 選擇分析變量和基本統(tǒng)計分析項
52、 Analyze →Descriptive Statistics ?→ Frequencies …打開Frequencies對話框,選擇檢驗變量男性紅細胞量blood并點擊 Statistics …按鈕打開Frequencies: Statistics對話框,選擇Mean、Sum、Std.deviation、Minimum、Maximum和S.E.mean,點擊Continue按鈕,點擊Charts…按鈕打開Frequencies
53、: Charts對話框,選擇Histograms并選擇? With normal curve選項, 點擊Continue按鈕,再點擊OK按鈕完成。,2013.11.6,85,,,對于連續(xù)變量 不選此項,,,,,,,,2013.11.6,86,3. 結果判讀 輸出結果見表5.7和圖5.9,從圖5.9 可見該變量基本服從正態(tài)分布。,,,,S,表 5.7,2013.11.6,87,圖 5.9,2013.11.6,88,S
54、PSS常用的描述統(tǒng)計量的中英文參見表5.3。,2013.11.6,89,參見“用Excel作統(tǒng)計分析.xls”文檔;參見《Excel在統(tǒng)計分析中的應用》,劉鋼主編,人民衛(wèi)生出版社:2002;參見《Excel與數據分析》,宇傳華 顏杰編著,電子工業(yè)出版社:2002;,4. Excel的統(tǒng)計分析方法,2013.11.6,90,5. Android系統(tǒng)的統(tǒng)計應用,參見“NewStatisticalToolsforAndroid.PPT
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