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文檔簡介
1、重金屬污染是世界普遍存在的環(huán)境問題。修復和治理重金屬污染的研究中,微生物修復治理是一條有效的途徑,其中一個重要的工作即使從環(huán)境中篩選和獲得能耐受和高富集重金屬的微生物,在此基礎上進一步優(yōu)化而達到修復和治理環(huán)境中重金屬的目的。現(xiàn)代微生物學和分子生物學技術的蓬勃發(fā)展為此方面的研究提供了高效便利的手段。當前相關研究的一個重點仍在于獲得重金屬高耐受和富集的微生物,并試圖從其機理上有所突破和利用。 本研究主要分兩部分,首先利用生物信息學
2、對將常見微生物的重要Cd相關蛋白-Cd轉運蛋白(Cadmium Resistance Transporter)進行同源比對及進化分析。研究發(fā)現(xiàn):Cd轉運蛋白的氨基酸序列具有明顯的種屬特異性,來源于同一個屬的蛋白質序列很好的聚類。葡萄球菌(Staphylococcus)Cd轉運蛋白屬內存在較大的差異,而芽孢桿菌屬(Bacillus)以及分枝桿菌屬(Mycobacterium)的蛋白序列有較好的保守性;它們都是4次以上跨細胞膜蛋白,這與跨膜
3、轉運的功能一致,體現(xiàn)了蛋白質結構和功能的統(tǒng)一。Cd轉運蛋白質序列的二級結構主要是α-螺旋,β-折疊和無規(guī)則卷曲,除B.cereus.R309803外,序列中最多的二級結構是α-螺旋。從三級結構域預測發(fā)現(xiàn),Cd轉運蛋白序列折疊主要以藥物輸出轉運子AcrB跨膜蛋白(multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain)為主,此種結構非常穩(wěn)定、高效。 在生物信息分析的基礎上,對
4、Cd耐受或富集微生物進行了篩選、優(yōu)化和鑒定,并對其Cd吸附及作用機理進行了初步的研究和探討。采集來自成都郊區(qū)某化工廠排污口污泥,稀釋濃度后,利用Cd2+濃度梯度遞增法分離篩選。在200mg/L,Cd2+培養(yǎng)基上得到了一株具有較高抗性的菌株,結果如下: ·進行形態(tài)學分析,生理生化實驗,16SrDNA鑒定,菌株確定為陰溝腸桿菌(Enterobacter cloacea)。 ·該菌株生長速度快,環(huán)境要求低,能夠在M9培養(yǎng)基
5、上生長。經(jīng)過紫外誘變,對Cd的吸附能力提高9%,吸附量達到54mg/g。 ·菌株能在1500mg/L Cd2+液體培養(yǎng)基,400mg/L Cd2+固體培養(yǎng)基中生長。菌株的最佳生長條件是:pH6.4牛肉膏培養(yǎng)基,34℃培養(yǎng),液體培養(yǎng)22—34h為宜。 ·菌株不含抗性質粒,對Cd的抗性可能由基因組編碼。透射電鏡(TEM)觀察細菌吸附Cd后的變化,分析結果表明:吸附Cd2+后細胞表面粗糙,呈不規(guī)則的凸起,菌體膨大,周圍有沉
6、淀。細菌可能分泌某種化合物與Cd2+產(chǎn)生沉淀。細胞質中出現(xiàn)大小不一的空泡,證明了Cd對細菌的毒害作用,菌體出現(xiàn)凋亡特征。陰溝腸桿菌耐鎘機理初步判斷為胞外沉淀。 最后經(jīng)查閱資料和實驗分析得出以下結論:生物信息學分析對實驗有指導輔助作用;Cd轉運蛋白(Cadmium Resistance Transporter)有明顯的種屬特異性和相類似的三級結構;篩選得到陰溝腸桿菌(Enterobacter cloacea)對Cd具有高耐受高富
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