蛋白網(wǎng)絡(luò)聚類(lèi)研究及其可視化軟件開(kāi)發(fā).pdf_第1頁(yè)
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1、本文對(duì)網(wǎng)絡(luò)中的聚類(lèi)算法進(jìn)行了研究，提出了一種能滿(mǎn)足蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)“塊內(nèi)緊密，塊間稀疏”的模塊化特點(diǎn)且簡(jiǎn)單易行的新的基于蛋白功能團(tuán)的拓?fù)鋵哟尉垲?lèi)方法――MCM算法。該算法打破了傳統(tǒng)的基于蛋白間相似度的聚類(lèi)模式，直接從蛋白功能團(tuán)的角度出發(fā)，考慮功能團(tuán)間的一階和二階相互作用，定義新的相似度，對(duì)最新的高通量的酵母蛋白網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類(lèi)分析，并預(yù)測(cè)模塊內(nèi)未知蛋白的功能。通過(guò)超幾何分布P值法和增、刪、改相互作用的方法對(duì)聚類(lèi)結(jié)果進(jìn)行預(yù)測(cè)能力分析和

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