神經(jīng)網(wǎng)絡在蛋白質二級結構預測中的應用研究.pdf

1、隨著新發(fā)現(xiàn)的蛋白質一級結構數(shù)量不斷增長，未知蛋白質二級結構的數(shù)量與已知蛋白質一級結構數(shù)量之間的差距不斷被拉大，這就迫切需要利用自動化方法來預測蛋白質二級結構。利用人工神經(jīng)網(wǎng)絡從蛋白質一級結構預測蛋白質二級結構便是一種高效的自動化方法，但這種方法預測的結果并不理想。為了提高蛋白質二級結構自動化方法預測的精度，不僅需要理想的預測引擎，而且需要高效的蛋白質一級結構序列編碼算法，從一級結構序列中提取更多與二級結構相關的生物進化信息。
　　

2、論文首先敘述了蛋白質二級結構預測的研究現(xiàn)狀和研究意義，并指出現(xiàn)有蛋白質氨基酸線性序列編碼算法存在的問題。然后根據(jù)最大限度從蛋白質一級結構氨基酸序列中獲取與蛋白質二級結構相關生物進化信息的思想，對現(xiàn)有的Profile氨基酸編碼方式進行改進。最后在對Profile編碼預測結果進行分析的基礎上，設計了一種可以從一級氨基酸序列中獲取更多二級結構生物進化信息的算法來提高二級結構預測的準確性，并依據(jù)改進算法進行了代碼實現(xiàn)。
　　論文實驗部分首