基于改進(jìn)BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu).pdf

1、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測在生物信息學(xué)研究中占有重要地位，而蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的關(guān)鍵步驟。本文結(jié)合氨基酸序列的編碼方式，介紹了幾種改進(jìn)BP算法在預(yù)測蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)中的應(yīng)用，并對網(wǎng)絡(luò)的學(xué)習(xí)過程及結(jié)果進(jìn)行分析和評價(jià)。主要研究內(nèi)容及成果如下： (1)首先了解蛋白質(zhì)一級及二級結(jié)構(gòu)的種類，并掌握其表示方法。從蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中隨機(jī)選取58條蛋白質(zhì)，對它們的氨基酸序列和對應(yīng)二級結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行提取和表示，為整個研究提供了原始數(shù)據(jù)；

2、(2)對已獲取的氨基酸序列及其二級結(jié)構(gòu)進(jìn)行編碼，為神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練和測試提供輸入、輸出數(shù)據(jù)。設(shè)計(jì)編碼方法時，考慮其可能對神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)、運(yùn)算能力以及最終預(yù)測精度的影響，提出了4種氨基酸序列的編碼方式，討論它們結(jié)合神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)時存在的問題及優(yōu)點(diǎn)； (3)基于標(biāo)準(zhǔn)BP算法在預(yù)測時存在的缺陷，介紹了3種改進(jìn)BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，從原理出發(fā)分析了它們改進(jìn)的具體內(nèi)容、改進(jìn)以后可能出現(xiàn)的特點(diǎn)以及相比較于標(biāo)準(zhǔn)BP算法有哪些優(yōu)點(diǎn)；