酵母雙雜交系統(tǒng)篩選豬流行性腹瀉病毒N蛋白互作宿主蛋白及N蛋白抗原表位鑒定.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、豬流行性腹瀉(porcine epidemic diarrhea,PED)是由豬流行性腹瀉病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)感染豬小腸細(xì)胞致使細(xì)胞死亡脫落從而引起的急性傳染病,主要臨床癥狀是水樣腹瀉、嘔吐,對(duì)7日齡以內(nèi)哺乳仔豬尤為易感。自2010年以來(lái),以變異PEDV為主要病原體的PED在我國(guó)爆發(fā),并迅速席卷全國(guó)及周邊亞洲國(guó)家,給養(yǎng)豬業(yè)帶來(lái)巨大的經(jīng)濟(jì)損失。PEDV為典型的單股正鏈RNA冠狀病

2、毒,與其他冠狀病毒一樣具有四個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白分別為纖突(Spike,S)蛋白、膜(Membrane,M)蛋白、小膜蛋白(Envelope,E)和核衣殼(Nucleocapsid,N),其中N蛋白是一個(gè)重要的結(jié)構(gòu)蛋白,并且高度保守,因此篩選PEDVN蛋白與宿主細(xì)胞的互作蛋白,以及篩選針對(duì)N蛋白抗原表位,對(duì)于探尋PEDV的致病機(jī)制和特異性新型疫苗研究等提供幫助。本實(shí)驗(yàn)研究?jī)?nèi)容及結(jié)果如下:
  (1)為了獲得與PEDV N蛋白相互作用的宿主蛋

3、白。本研究構(gòu)建豬流行性腹瀉病毒N蛋白基因的重組載體pGBKT7-N,以其作為誘餌質(zhì)粒,采用酵母雙雜交方法,經(jīng)過(guò)兩次缺失培養(yǎng)基篩選,從豬肺泡巨噬細(xì)胞cDNA文庫(kù)中篩選出與N蛋白相互作用的10個(gè)陽(yáng)性克??;將陽(yáng)性克隆的序列與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中序列比對(duì),結(jié)果顯示對(duì)應(yīng)著6種蛋白,分別為FTH1、LGALS3、CORO1C、SNRPG、KRTAP5-3和ZNF598,其中LGALS3和SNRPG兩種蛋白可能與病毒增殖及凋亡有關(guān),具有進(jìn)一步研究?jī)r(jià)值,因

4、此對(duì)這兩種蛋白進(jìn)行了回返、自激活和Co-IP實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,證實(shí) LGALS3和SNRPG蛋白確實(shí)與N蛋白存在特異的相互作用且排除了假陽(yáng)性的可能。本研究為進(jìn)一步研究豬流行性腹瀉病毒 N蛋白的功能及病毒的致病機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
  (2)為了篩選和鑒定N蛋白的抗原表位核心區(qū)域,本實(shí)驗(yàn)將N基因截短為4個(gè)相互重疊的DNA片段N1、N2、N3、N4,將其分別克隆到質(zhì)粒pCold I中,構(gòu)建出4個(gè)重組質(zhì)粒pCold I-N1、pCold I-N2、

5、pCold I-N3、pCold I-N4,通過(guò)IPTG誘導(dǎo),進(jìn)行分段融合蛋白原核表達(dá);將表達(dá)的分段蛋白再經(jīng) Western blot實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,結(jié)果顯示只有N1(1-126aa)、N2(107-230aa)與N蛋白單克隆抗體反應(yīng),說(shuō)明N蛋白的抗原表位區(qū)域在N1-N2(1-230aa)區(qū)域。同樣的方法與策略,將N1-N2(1-230aa)區(qū)域截短為10個(gè)相互重疊的DNA片段A1、A2、A3、A4、A5、A6、B1、B2、B3、B4,將其分

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