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文檔簡介
1、NADH氧化酶能以NADH為底物,在氧氣存在的條件下生成NAD+。它可以與以NAD+為輔酶的氧化還原酶偶聯(lián),在催化氧化還原反應(yīng)的同時(shí)生成NADH,從而使輔酶能夠循環(huán)再生,提高催化反應(yīng)的效率。雖然關(guān)于NADH氧化酶已有報(bào)道,但催化效率高且產(chǎn)物不含H2O2的較少。因此,制備高效NADH氧化酶具有現(xiàn)實(shí)意義。
本課題從變異鏈球菌(Streptococcusmutans ATCC25175)中克隆到產(chǎn)水型NADH氧化酶,并對其進(jìn)行了初步
2、的生物信息學(xué)分析、表達(dá)以及酶學(xué)性質(zhì)做了基本研究。
首先,從Pubmed中搜索并確定1種含假定存在的NADH氧化酶的菌株(變異鏈球菌Streptococcus mutans ATCC25175),并得到NADH氧化酶的主要生物學(xué)信息:目的基因SmNOX總長1374bp,共編碼457個(gè)氨基酸,產(chǎn)物分子量為49.93kDa。把SmNOX編碼的NADH氧化酶序列與數(shù)據(jù)庫中其他研究收錄的酶進(jìn)行比對,結(jié)果顯示,NOX基因編碼產(chǎn)物含1個(gè)半胱
3、氨酸,為該酶的催化中心。肽鏈中含有兩個(gè)FAD結(jié)合域(FAD-binding domain1(GANHAGT),F(xiàn)AD-binding domain2(TSIPDVYAIGDCA)和一個(gè)NADH結(jié)合域(NADH-binding domain(GAGYIGVELAE))。
其次,對菌中的NOX基因進(jìn)行了克隆表達(dá)。提取基因組后,根據(jù)DNA序列設(shè)計(jì)出兩對引物,并進(jìn)行PCR得到目的片段。擴(kuò)增出的SmNOX基因TA克隆于pGEM-T載體并
4、轉(zhuǎn)入大腸桿菌E.coli DH5α中。測序結(jié)果顯示,SmNOX基因序列中362位氨基酸發(fā)生了突變(F362L)。通過BamHI和XhoI限制酶分別切割pGEM-T-SmNOX與表達(dá)載體pET-28a(+),將的基因與表達(dá)載體連接后轉(zhuǎn)化進(jìn)入宿主菌BL21(DE3)。隨后誘導(dǎo)大腸桿菌表達(dá),對表達(dá)產(chǎn)物以SDS-PAGE驗(yàn)證。
然后,用Ni-NTA對SmNOX進(jìn)行了純化,SDS-PAGE顯示單一條帶。隨后對SmNOX進(jìn)行了酶學(xué)性質(zhì)表征
5、,結(jié)果表明:在FAD濃度為30μM、pH7.0、35oC條件下,NADH氧化酶達(dá)到最大比活力202.8U/mg,反應(yīng)中無需加入金屬離子,動(dòng)力學(xué)常數(shù)Km、Vmax以及kcat/Km分別為247.9μM、281.7U/mg和2×106s-1M-1,在室溫下放置3h后酶活力無明顯變化。
接著,篩選了一種來源于類球紅細(xì)菌(Rhodobacter sphaeroides2.4.1 ATCC BAA-808)的短鏈脫氫酶RsGDH(Gen
6、Bank:HQ441199),該基因長780bp,編碼259個(gè)氨基酸,蛋白分子量約為26.416kDa,經(jīng)同源序列比對發(fā)現(xiàn),該基因編碼產(chǎn)物中含有一個(gè)NAD結(jié)合域(NAD-binding(TGGTQGAG)),用以結(jié)合輔酶NAD+,且與其他半乳糖醇脫氫酶有共同的殘基Asn,Ser,Tyr,Lys,這些殘基構(gòu)成了該酶的催化活性位點(diǎn),因此鑒定該酶為半乳糖醇脫氫酶(RsGDH)。隨后以同樣的方式對RsGDH基因進(jìn)行克隆表達(dá),克隆后大小與已知GD
7、H序列相同,但308位堿基發(fā)生了突變(A308G)。用EcoRI和Hind III切割pGEM-T-RsGDH與pET-28a(+)后,將其轉(zhuǎn)化至BL21(DE3)進(jìn)行表達(dá), RsGDH基因產(chǎn)物以胞內(nèi)可溶蛋白和包涵體兩種形態(tài)存在。
最后,對RsGDH進(jìn)行性質(zhì)表征。結(jié)果表明:該半乳糖醇脫氫酶有廣泛的底物特異性,其中以半乳糖醇為底物時(shí)有最大酶活力。與輔酶NADP+相比,RsGDH具有更好的NAD+依賴性,且以金屬Ca2+為輔因子。
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