天然蛋白酶體抑制劑的虛擬篩選研究.pdf

1、第一部分天然蛋白酶體抑制劑的虛擬篩選
　　目的：通過模擬硼替佐米與20S蛋白酶體的結合證明用分子對接的方法進行PI虛擬篩選的可行性,并進一步從天然小分子結構數(shù)據(jù)庫中篩選出潛在的蛋白酶體抑制劑。
　　方法：采用分子對接的方法進行虛擬篩選可行性研究,用藥效團模型方法,分子對接方法,原型分子形狀相似性等方法組成梯度多步驟篩選策略進行數(shù)據(jù)庫搜索篩選可能的蛋白酶體抑制劑。
　　結果：分子對接模擬中硼替佐米能夠與20S蛋白酶體活性

2、部位較好結合,結合模式與晶體結構中相關模式高度吻合,已知蛋白酶體抑制劑均能夠與蛋白酶體較好結合,且預測活性與實際活性呈線性相關,模擬還顯示沒有蛋白酶體抑制活性的化合物不能與蛋白酶體穩(wěn)定結合;篩選出了五十余具有潛在蛋白酶體抑制劑活性的化合物,其中包含已知的姜黃素和茶多酚及雷公藤紅素等,文獻也顯示這些化合物多數(shù)具備抗炎抗病毒或者抗腫瘤活性,其中多種分子還具有明確抗白血病作用。
　　結論：虛擬篩選方法可以用于蛋白酶體抑制劑的虛擬篩選,篩

3、選出的多種化合物具有潛在蛋白酶體抑制劑活性
　　第二部分蛋白酶體抑制劑篩選結果的實驗驗證
　　目的：測定篩選出的化合物是否具備蛋白酶體抑制活性及大體測定其半抑制濃度的圍,進一步證明虛擬篩選方法用于蛋白酶體抑制劑篩選的可行性。
　　方法：熒光標記法測定天然化合物對蛋白酶體的抑制作用。蛋白酶體分解熒光底物,釋放熒光物質,通過對熒光強度的檢測反映抑制強度的高低,并估算出其大概的IC50范圍.
　　結果：10種化合物可以