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文檔簡介
1、目的:篩選哈薩克族食管鱗癌甲基化基因,并研究其病理學意義。
方法:在細胞水平,采用人類全基因組寡核苷酸微陣列芯片,熒光雙交換法檢測5-雜氮-2’-脫氧胞苷(5-aza-CdR)干預的食管鱗癌細胞Eca109與正常培養(yǎng)的Eca109細胞中的差異表達基因,通過甲基化特異性PCR(MSP)和實時熒光定量PCR(qRT-PCR)分別驗證其甲基化狀態(tài)和表達量變化;在組織水平,選取18對哈薩克族食管鱗癌組織樣本,通過MSP和qRT-PCR
2、進一步驗證細胞水平篩選出的高度甲基化基因的甲基化狀態(tài)和表達量變化,并分析其與哈薩克族食管鱗癌患者臨床病理參數(shù)的相關性。
結果:經(jīng)5-aza-CdR干預的Eca109細胞形態(tài)發(fā)生改變,細胞密度降低,細胞間接觸變松,細胞體積增大,細胞內可見大量空泡,呈凋亡形態(tài),存活細胞數(shù)減少?;蛐酒Y選獲得384個差異表達基因,其中303個基因表達上調,81個基因表達下調;表達上調基因中,組織因子途徑抑制物-2(TFPI2)基因表達上調11.4
3、2倍,在Eca109細胞中,重復驗證的MSP結果顯示:正常培養(yǎng)組甲基化陽性,干預組非甲基化陽性;其啟動子區(qū)甲基化陽性率在哈薩克族食管鱗癌組織中為45%。TFPI2基因表達量在細胞水平和哈薩克族食管鱗癌組織均有顯著差異(p<0.05)。A激酶錨定蛋白12(AKAP12)基因表達上調4.05倍,但其啟動子區(qū)甲基化在食管鱗癌發(fā)生率均較低,在細胞水平和哈薩克族食管鱗癌組織表達量無統(tǒng)計學差異。TFPI2基因表達量及甲基化均與哈薩克族食管鱗癌組織的
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