CDH17基因單核苷酸多態(tài)性與胃癌的相關(guān)性.pdf

1、背景與目的:在當今世界,惡性腫瘤已經(jīng)成為了威脅人類健康疾病之一,其嚴重影響了患者的生命質(zhì)量。尤其是對早期診斷困難、侵襲轉(zhuǎn)移速度快、5年生存率低的惡性腫瘤來說,更是加重了人類的負擔。胃癌是威脅人類生命健康最常見的惡性腫瘤之一,每年大約有70萬的人口死于胃癌。在全球最常見的惡性腫瘤中胃癌排第4位,僅次于肺癌、腸癌和乳腺癌。胃癌癌變的遺傳機制很復雜,目前尚沒有將基因檢測應用在胃癌的臨床實踐中,但是隨著胃癌分子病理學的進步,人們對胃癌的認識有了

2、顯著的提高。開展遺傳檢測,基于遺傳學研究的新型生物標記物已廣泛應用于科研領域。
　　 單核苷酸多態(tài)性(簡稱SNPs)是第三代遺傳標記,是個體基因變化最重要的形式之一。單核苷酸多態(tài)性具有分布廣泛、遺傳穩(wěn)定性和易于快速、規(guī)?；Y查等優(yōu)點。目前,基因的單核苷酸多態(tài)性與疾病的遺傳易感性、患者對臨床藥物治療的敏感性、預后等領域得到重視和研究,將對與基因相關(guān)疾病(如腫瘤)的預防、早期診斷及臨床個體化治療方案的選擇發(fā)揮積極的作用。
　　

3、 CDH17基因即cadherin17,又稱為LI-cadherin或liver-intestine cadherin,位于8q22.1,是鈣黏蛋白超家族中特殊的一員,是與胃癌相關(guān)的粘附分子基因,在介導細胞連接等方面有其自身特點。本實驗分析CDH17基因外顯子6A58G位點和外顯子17A49C位點基因型分布頻率與等位基因型分布頻率,旨在探討該兩個位點的單核苷酸多態(tài)性與胃癌人群的遺傳易感性、臨床病理因素之間是否有關(guān),以期為胃癌發(fā)生發(fā)展的

4、分子機制提供理論依據(jù)。
　　 材料與方法:
　　 1.采集68例中國河南省漢族胃癌患者外周靜脈血標本,采集時間為2009年12月至2010年4月。68例胃癌患者均在鄭州大學第一附屬醫(yī)院住院治療,于患者術(shù)前采血1ml保存?zhèn)溆谩?br>　　 2.采用離心柱法、溶液法對68例中國河南省漢族胃癌患者的外周靜脈血基因組DNA進行提取。
　　 3.采用聚合酶鏈式反應-單鏈構(gòu)象多態(tài)性(PCR-SSCP)法對68例中國河南省漢

5、族胃癌患者的CDH17基因外顯子6A58G位點和外顯子17A49C位點進行基因分型的篩選,并使用DNA直接測序法對基因分型結(jié)果進行驗證。
　　 4.統(tǒng)計學處理:采用SPSS17.0統(tǒng)計軟件,對無序分類資料采用x2檢驗,以優(yōu)勢比(OR)及其95％可信區(qū)間(95％CI)表示相對風險度,運用Logistic回歸模型計算OR及其95％CI；對有序分類資料采用秩和檢驗,通過比較平均秩次判斷風險度大小。統(tǒng)計檢驗中涉及單雙側(cè)概率時,采用雙側(cè)概

6、率檢驗,取檢驗水準α=0.05,對于多分類樣本中每兩類間的比較采用Bonferroni法。
　　 結(jié)果:
　　 1.CDH17基因外顯子6A58G位點基因型A／G型有52例(76.47％),G／G型有11例(16.18％),A／A型有5例(7.35％)。等位基因G的頻率為54.41％,等位基因A的頻率為45.59％。
　　 2.CDH17基因外顯子6A58G位點基因型分布頻率與胃癌患者的性別、年齡、腫瘤直徑、大體

7、形態(tài)、組織學類型、浸潤深度、分化程度無關(guān),與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TNM分期有關(guān)。
　　 3.CDH17基因外顯子17A49C位點基因型A／C26例(38.24％),基因型A／A17例(25.00％),基因型C／C25例(36.76％)。等位基因A頻率為44.12％,等位基因C頻率為55.88％。
　　 4.CDH17基因外顯子17A49C位點基因型分布頻率與胃癌患者的性別、年齡、腫瘤直徑、大體形態(tài)、組織學類型、浸潤深度、分化程度

8、、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和TNM分期均無關(guān)。
　　 結(jié)論:
　　 (1)CDH17基因外顯子6A58G位點的單核苷酸多態(tài)性與胃癌的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TNM分期有關(guān),可能基因改變影響胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白功能改變。
　　 (2)CDH17基因外顯子17A49C位點的單核苷酸多態(tài)性與胃癌人群的性別、年齡、腫瘤直徑、大體形態(tài)、組織學類型、浸潤深度、分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TNM分期無關(guān)。
　　 (3)CDH17基因外顯子6A58G位點的