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文檔簡介
1、定量結構一活性/性質關系(Quantitative Structure-Activity/Property Relationship,QSAR/QSPR)作為化學信息學的一個分支,是目前國際上研究的熱點之一,它主要是應用各種理論計算方法和統(tǒng)計學方法研究化合物的結構與其生物活性/理化性質之間的關系。近年來,隨著計算機技術的發(fā)展和應用,QSAR/QSPR的研究提高到了一個新的高度,研究方法逐漸成熟,其應用范圍也迅速擴大,研究領域涉及化學、化
2、工、藥物化學、環(huán)境化學等諸多學科。建立準確、高效的定量結構-活性/性質關系模型,能從分子水平上理解化合物的微觀結構同其宏觀活性/性質之間的關系,為設計、篩選或預測具有人們期望的性質的化合物提供有用信息,并根據已有的知識,探求化合物活性/性質與結構的相互作用規(guī)律,從而推論呈現(xiàn)化合物某些活性/性質的影響因素,因此具有很好的應用前景及重要的理論和實際意義。
本論文從分子結構的定量描述和結構性質定量關系的建立入手,研究了QSPR方
3、法在大量有機化合物重要理化性質預測方面的應用,建立可靠的QSPR模型,為化學、化工及環(huán)境污染物等方面的研究提供了有力的依據。
論文第一章對定量結構-活性/性質關系研究進行了概述。簡述了定量結構-活性/性質關系的基本原理,實現(xiàn)步驟以及研究現(xiàn)狀,并總結了它在近年來的一些重要應用。
第二章利用QSPR研究方法,將遺傳算法(Genetic Algorithm,GA)和多元線性回歸方法(Multiple Linear
4、Regression,MLR)結合,分別建立了預測4874個有機化合物氣相導熱系數(shù)的QSPR模型和預測3635個有機化合物液相膨脹系數(shù)的QSPR模型。氣相導熱系數(shù)的QSPR模型,包含5個描述符。結果顯示,對于訓練集R2=0.852,Q2=0.851,RMSE和AARD分別是0.07和2.22%,測試集的統(tǒng)計結果是R2=0.75,RMSE=0.09,AARD=2.81%。液相膨脹系數(shù)的QSPR模型,包含6個描述符,對于訓練集R2=0.81
5、3,Q2=0.810,RMSE和AARD分別是0.045和1.02%,測試集的統(tǒng)計結果是R2=0.811,RMSE=0.061,AARD=1.425%。這兩個模型對于大數(shù)據集來說,是穩(wěn)健可靠的,具有較好的預測能力,可以用于預測新化合物的相關性質。
第三章研究了4905個有機化合物的氣相粘度與其結構之間的定量關系。用LLR建立了局部模型,并對LLR和MLR建立的局部模型和全局模型的預測能力做了比較。遺傳算法選擇的參數(shù)為3個,
6、局部建模后得到訓練集的統(tǒng)計結Q2=0.93,R2=0.95,RMSE和AARD分別是0.031和0.87%,測試集的統(tǒng)計結果是R2=0.88,RMSE=0.04,AARD=1.67%,結果表明,LLR方法建立的局部模型的預測能力較MLR建立的全局模型有很大提高。訓練集的Q2比MLR方法提高了3%,測試集的R2比MLR提高了4%,同時測試集的RMSE和AARD值都有顯著降低,充分說明用LLR建立的局部模型能夠更加準確有效地預測有機化合物的
7、氣相粘度。
第四章將遺傳算法(Genetic Algorithm,GA)和多元線性回歸方法(Multiple Linear Regression,MLR)結合,分別建立了預測3242個有機化合物折射率的QSPR模型,模型包含6個描述符。結果顯示,訓練集的R2=0.826,Q2=0.823,RMSE=0.022,AARD=0.81%;測試集的R2=0.840,RMSE=0.029,AARD=1.23%。通過討論模型的結構描述
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