人類基因表達和調(diào)控模式發(fā)現(xiàn)與綜合知識庫構(gòu)建.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、測序和基因組學(xué)產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù)促成了生物信息學(xué)這門交叉學(xué)科的誕生,它的最終目的就是利用這些數(shù)據(jù)分析和解釋各種生理活動,而基因表達和調(diào)控的研究是這門學(xué)科的重要內(nèi)容。生物體中的新陳代謝和信號通路,疾病在基因?qū)哟蔚闹虏C理和對藥物治療的反饋等都和基因表達與調(diào)控密切相關(guān)。所以,對基因表達與調(diào)控的研究將會極大地幫助其他方面的研究。本文的主要內(nèi)容如下:
  為了全面的評估人類基因表達,我們搜集和篩選了600個人類微陣列數(shù)據(jù)集,并從4個維度對數(shù)據(jù)

2、進行提取和分類:1)在細(xì)胞、組織或者和器官層次的表達數(shù)據(jù);2)在胎兒、青年和老年生長階段的表達數(shù)據(jù);3)在疾病和健康狀態(tài)下的表達數(shù)據(jù);4)在不同化學(xué)處理下的時間序列表達數(shù)據(jù)。對于提取的數(shù)據(jù),我們應(yīng)用了2個統(tǒng)計方法來評估基因的表達,用戶可以在這兩個方法上設(shè)置不同的閾值,來得到特異性表達的基因和看家基因。
  在生物體中,一般都是由一組基因來執(zhí)行某種功能。根據(jù)一組基因在不同條件下表達水平,可以發(fā)掘基因的表達模式或者所處條件的相似性。針

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