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文檔簡介
1、目的:應用生物信息學方法和分子生物學技術,在宮頸癌Hela細胞中預測并驗證miR-21的相關靶基因,探討miR-21與靶基因的相互作用及其與宮頸癌發(fā)病的關系,為進一步研究宮頸癌發(fā)生的分子機制和宮頸癌基因治療方法提供新的思路和實驗依據(jù)。
方法:⑴應用生物信息學方法分析miR-21的染色體定位、保守性分析等,利用網絡共享軟件MicroCosm Targets、TargetScan和PicTar,分析其可能作用的靶基因。⑵用脂質
2、體轉染的方法,將美國Ambion公司合成的pre-miR-21、pre-miRnegative control和anti-miR-21、anti-miR negative control瞬時轉染入Hela細胞中,實時熒光定量PCR(qRT-PCR)方法檢測miR-21相對表達量。⑶蛋白免疫印跡方法(Western-blot):提取細胞總蛋白,經電泳、轉膜、PDCD4抗體孵育,曝片顯影,利用軟件對PDCD4蛋白的相對含量進行分析。⑷熒光素
3、酶報告實驗:將PDCD4分子的3'UTR序列中miR-21結合位點上下游的部分片段導入pMIR-REPORT-luciferace熒光素酶報告基因載體,構建重組載體(pMIR-Luc-PDCD4),并進行酶切及測序鑒定。以重組載體(pMIR-Luc-PDCD4)、標準化對照載體(pMIR-REPORT-β-gal)與pre-miR-21或anti-miR-21共轉染Hela細胞(實驗組),72小時后分別檢測Hela細胞的熒光素酶(Luc
4、)和β半乳糖苷酶的活性,計箅二者的比值(Luc/β-gal)。同時設立三個對照組(no miRNA空白對照組、pre-miR-negative對照組和anti-miR-negative對照組),比較各組Luc/β-gal比值,驗證miR-21作用靶點的真實性。
結果:①利用在線軟件PicTar、MicroCosm Targets和TargetScan預測miR-21的作用靶基因。結果發(fā)現(xiàn)PDCD4可能是miR-21作用的靶
5、基因。②Western blot結果發(fā)現(xiàn),轉染pre-miR-21后,細胞中PDCD4蛋白的表達水平下調(P<0.01);轉染anti-miR-21后,細胞中PDCD4蛋白的表達水平上調(P<0.05)。③利用pMIR-REPORT熒光素酶報告基因載體,經酶切鑒定和測序驗證,成功構建重組載體pMIR-Luc-PDCD4-3'UTR。pMIR-REPORT熒光素酶實驗結果表明,三個對照組(no miRNA空白對照組、pre-miR-neg
6、ative對照組和anti-miR-negative對照組),Luc/β-gal比值接近。實驗組,pre-miR-21共轉染組,熒光素酶活性下降約43%(P<0.001);anti-miR-21共轉染組,熒光素酶活性升高約37%(P<0.001),表明PDCD4是miR-21的真實作用靶點。
結論:⑴在宮頸癌Hela細胞中,miR-21調控抑癌基因PDCD4蛋白的表達,PDCD4是miR-21的重要靶基因。⑵miR-21在
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