拷貝數(shù)變異相關(guān)長鏈非編碼RNA對肝癌發(fā)生發(fā)展的影響及機制研究.pdf

1、肝細胞肝癌（Hepatocellular Carcinoma, HCC）是最常見的惡性腫瘤之一，在惡性腫瘤引起的死亡中僅次于胃癌和食道癌，居第三位。肝癌發(fā)生的一個最主要的危險因素就是肝炎病毒的感染，在東亞地區(qū)，尤其是在中國，乙型肝炎病毒的感染對于肝癌發(fā)生至關(guān)重要。流行病學(xué)調(diào)查發(fā)現(xiàn)，乙型肝炎病毒感染導(dǎo)致的肝癌具有非常明顯的家族聚集性和遺傳易感性。說明肝癌發(fā)生存在著遺傳學(xué)的改變，從基因組水平探討肝癌發(fā)生的原因和易感機制，對于肝癌臨床的早期診

2、斷和預(yù)后的觀察都會具有十分重要的意義?；蚪M拷貝數(shù)的變異(Copy Number Variations，CNVs)是多種腫瘤，包括肝癌，發(fā)生的重要事件。之前的研究中，對于拷貝數(shù)變異的解析更多的關(guān)注于蛋白編碼基因，然而蛋白編碼基因并不足以充分解釋腫瘤發(fā)生過程中的拷貝數(shù)變異事件。在很多的高頻拷貝數(shù)變異區(qū)段，并不能用已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的蛋白編碼基因的功能來解釋變異區(qū)段和腫瘤發(fā)生的關(guān)系，也有很多變異區(qū)段位于編碼基因的荒漠地帶，這些現(xiàn)象提示我們將拷貝數(shù)變異

3、與非編碼轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物聯(lián)系起來，進行非編碼RNA在肝癌中的拷貝數(shù)變異研究。其中長鏈非編碼RNA(Long Non-coding RNA, lncRNA)是一類轉(zhuǎn)錄本長度大于200nt的非編碼RNA產(chǎn)物，雖然不編碼表達蛋白，但能夠在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后和染色體修飾等多個層面，調(diào)控胚胎發(fā)育、細胞增殖、轉(zhuǎn)移和分化等各種生命活動，其異常表達與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)，近年來關(guān)于lncRNA與肝癌關(guān)系的研究已經(jīng)成為肝癌研究新的熱點。因此探討拷貝數(shù)變異是否通過

4、調(diào)控lncRNA影響了肝癌的發(fā)生發(fā)展顯得尤為重要。
　　 在本研究中，我們通過整合了肝癌臨床樣本的lncRNA表達譜芯片數(shù)據(jù)和基因組拷貝數(shù)變異數(shù)據(jù)，篩選驗證得到了肝癌中拷貝數(shù)變異相關(guān)的lncRNA。其中，長鏈非編碼RNA lncRNA-PRAL(P53 Regulation Associated LncRNA)在肝癌樣本中存在著高頻的拷貝數(shù)缺失，并導(dǎo)致了轉(zhuǎn)錄本水平的顯著性低表達。lncRNA-PRAL基因組的缺失與肝癌病人的臨床

5、預(yù)后相關(guān)，顯示lncRNA-PRAL作為肝癌病人預(yù)后觀察指標的應(yīng)用價值。并且進一步研究發(fā)現(xiàn)，lncRNA-PRAL的表達水平同時也與HBV感染相關(guān)，HBV的感染與拷貝數(shù)變異對lncRNA-PRAL的調(diào)控存在著協(xié)同作用。通過lncRNA-PRAL的干擾和過表達，我們發(fā)現(xiàn)lncRNA-PRAL可以在體內(nèi)體外促進肝癌細胞的凋亡。進行深入研究，發(fā)現(xiàn)lncRNA-PRAL可以通過直接結(jié)合HSP90的蛋白分子，促進HSP90和p53的結(jié)合能力，從而

6、增強了p53的入核過程，提高了p53在胞核中的表達量，引起了腫瘤細胞的凋亡。通過我們的研究，我們確定了lncRNA-PRAL在肝癌中的高頻缺失是肝癌發(fā)生發(fā)展中的一個重要事件，可以作為肝癌臨床預(yù)后的診斷標記物和治療的潛在靶點。
　　 通過探討拷貝數(shù)相關(guān)lncRNA在肝癌發(fā)生發(fā)展中的重要作用，不但豐富了拷貝數(shù)變異對肝癌發(fā)生發(fā)展的機制，強化了遺傳學(xué)改變與表觀遺傳學(xué)調(diào)控的關(guān)系，同時也完善了細胞lncRNA的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，深化了lncRNA對